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器官和组织再生过程中染色质的动态变化

导读 来自巴塞罗纳大学遗传、微生物和统计系以及生物医学研究所的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因及其表达所需的调控元件。以及

来自巴塞罗纳大学遗传、微生物和统计系以及生物医学研究所的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因及其表达所需的调控元件。以及组织和器官再生的过程。该研究发表在《基因组研究杂志》封面,通过新一代测序将经典遗传分析与新的染色质研究技术相结合,为再生医学提供了新的视角。

这项研究的参与者是埃琳娜维斯卡亚-莫利纳(UB)和塞西莉亚克莱因(UB-CRG),这是本文的第一批署名者,由蒙特塞拉特科罗米纳斯(UB)领导。其他合作者是研究人员罗德里克吉吉戈(CRG,庞贝法布拉大学)、弗洛伦西塞拉(UB)和拉克什米什拉(CCMB,海得拉巴)。

再生基因

本文分析了果蝇翅膀不同再生阶段成像盘的转录组。通过分析大规模的核糖核酸测序,他们发现了在这个过程中差异表达的基因。此外,他们发现这些基因中有30%以上位于基因簇中。通过比较和分析其他物种(小鼠和斑马鱼),作者发现了一组参与再生的基因,这些基因在所有这些物种中都是保守的。Elena Vizcaya-Molina指出:“知道哪些基因可以再生——这些基因有一些共同点,可以帮助我们了解在再生技能较为有限的生物体(如人类)中,激活这一过程需要什么条件。

“这项研究表明,组学和生物信息学对于理解基本生物过程变得越来越重要,”CRG博士后研究员、UB讲师Cecilia Klein指出。新的测序技术以及生物信息学分析和实验研究的结合使研究人员能够在理解基因调控方面取得进展。在这种情况下,再生。

再生中的调节因素。

在这项研究中,研究人员还首次发现了三种与再生相关的调节元件:在再生过程中增加活性的调节元件、从其他发育阶段或其他组织中重复使用的调节元件,以及最后一组,再生过程中的独特元件。“这些调控元件是可以导致和塑造基因表达的DNA序列,”Elena Vizcaya说。此外,作者发现这些元素可能被物种(苍蝇、老鼠和斑马鱼)中的一些保守基因激活。“再生特定调节元件的异位激活可能是提高不能再生器官再生能力的关键工具,”专家Montserrat Corominas总结道。

作为再生的模式动物,苍蝇。

自古以来,再生就引起了人们极大的兴趣,比如希腊神话中的传说。然而,被称为果蝇的果蝇的再生能力直到20世纪40年代才被发现,当时是由一位再生医学之父发现的。托马斯摩根看到苍蝇的成像盘(成体表皮结构中的原始盘)被打碎后可以再生。飞行被认为是研究再生的模型。

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