加州欧文2021年1月27日讯，由加州大学欧文分校领导的一项新研究发现了一种识别生物标志物的新方法，可以帮助早期癌症诊断。这项研究的重点是肺癌，但细胞异质性调节的甲基化甲基化(CHALM)也已被测试用于衰老和阿尔茨海默病，有望用于研究其他疾病。
“我们发现CHALM方法可能是一个有价值的工具，可以帮助研究人员从基于序列的甲基化数据中识别更可靠的差异甲基化基因，”生物系生物信息学教授李莉和Grace B. Bell教授说。UCI医学院化学专业。“对于临床医生来说，这种方法可以帮助他们识别更有用的生物标志物，从而帮助癌症诊断，而传统方法忽略了这些生物标志物。”
该研究发表于《自然通讯》，题目为“细胞异质性调节甲基化(CHALM)改善基因表达预测”，显示了从测序数据计算DNA甲基化水平时考虑细胞异质性的重要性。
“在将我们的CHALM方法应用于肺癌数据集后，我们可以识别与生物功能相关的更可靠的差异甲基化基因。我们的CHALM方法的应用可能会导致更好的早期癌症检测，”李说。
研究人员利用传统方法鉴定癌症生物标志物，发现基因表达与启动子甲基化的相关性较弱，尤其是对于甲基化程度较低的基因。这项新的研究发现，CHALM方法可以更可靠地识别传统方法无法检测到的甲基化标志物。
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