虽然明亮的光线可以帮助我们看得更清楚，但我们的眼睛需要黑暗才能获得更好的视力。光每天都会破坏我们眼睛的敏感机器，而在黑夜中，关键部件会被重建。我们的昼夜节律时钟运行着这个过程，研究人员发现，如果时钟被打乱，随着年龄的增长，我们的眼睛可能面临更大的视网膜退化风险。
领导这项研究的普渡大学农学院生物化学副教授 Vikki Weake 说：“想象一下，我们是否可以减缓或防止视网膜退化导致的视力丧失。”“要做到这一点，我们需要了解驱动与年龄相关的变化的分子机制以及影响它们的外部和内部因素。在这项研究中，我们发现生物钟在视网膜与年龄相关的变化中起着令人惊讶的重要作用. 这个内部时钟可能对防止视网膜退化和维持眼睛健康至关重要。”
该团队研究了果蝇的眼睛，这是一种常见的人眼模型。然而，这项研究在衰老过程中使用多个时间点并不常见，重点是感光神经元和新的数据分析方法。PLOS Genetics上的一篇论文详细介绍了这些发现。
“在我们早期的研究中，只关注基因表达，我们错过了故事的一部分，”Weake 说。“通过观察在衰老过程中改变对潜在 DNA 的访问的染色质变化，我们能够确定一些在衰老的眼睛中驱动这些基因表达变化的转录因子。”
Weake 感谢博士生 Juan "Jupa" Jauregui-Lozano 对所使用的生物信息学技术的想法和应用。
“我发现了一种强大的生物信息学技术，可以识别转录因子活性的变化，帮助我们了解基因调控，”Jauregui-Lozano 说。“结果表明，转录因子 Clock 和 Cycle——以其在昼夜节律中的作用而闻名——显示出随着年龄的增长而逐渐发生的活动变化。这符合我们对眼睛生物学的了解，这种公正的方法使我们将 Clock 和 Cycle 确定为有趣的研究目标。”
这项名为 diffTF 的技术着眼于不同条件下染色质中 DNA 可及性的变化。它产生了一组潜在的候选人来追求，而不是一个从目标基因开始的研究团队。
标签：
免责声明：本文由用户上传，如有侵权请联系删除！