在一项首创的实验中,研究人员确定了 127 个基因与免疫疾病之间的联系,为 T 细胞激活过程中基因活动的序列和时间提供了新的见解,这是调节身体免疫反应的关键过程。
该研究由 Open Targets、威康桑格研究所和葛兰素史克的研究人员领导,于今天(2022 年 5 月 26 日)在Nature Genetics上发表。这是一项 3 年研究努力的结果,它首次表明在 T 细胞激活的不同阶段,许多与疾病相关的变体是活跃的,为指导开发针对类风湿性关节炎等免疫疾病的新疗法提供了关键信息,类型-1 糖尿病和克罗恩病。
T细胞是一组有助于管理人体免疫系统的白细胞。当 T 细胞发生故障时,它们会导致严重的免疫缺陷,使患者面临感染的高风险,以及更常见的自身免疫性疾病,如 1 型糖尿病和类风湿性关节炎,身体会对自身细胞发起攻击。
T 细胞活化是免疫系统对感染作出反应的第一步。在分子水平上绘制这个激活周期对于了解它可能出错的地方以及在哪些点治疗干预可以影响这个过程至关重要。但迄今为止,仅绘制了有限的激活序列快照,例如在单个时间点查看细胞。这些快照技术也无法捕获每个阶段存在的细胞亚型的多样性。Open Targets 之前的研究表明,与免疫疾病相关的 DNA 的某些变异与 T 细胞的激活过程有关。
在这项新研究中,威康桑格研究所和葛兰素史克的研究人员使用单细胞 RNA 测序技术对超过 650,000 个单个细胞进行了分析,以绘制 T 细胞激活过程中每个细胞亚型的基因活动时间。他们确定了受 DNA 变化调控的基因,这些基因在 T 细胞激活期间从静止状态到三个不同时间点在每个细胞中打开或关闭。
该团队确定了超过 6,400 个参与激活过程的基因。通过将他们的数据与 13 种免疫疾病的已知遗传变异进行比较,他们能够找到与这些疾病相关的 127 个基因,其中一些仅在以前未研究过的特定时间点出现。
来自 Wellcome Sanger 研究所的该研究的第一作者 Blagoje Soskic 博士说:“通过分析 T 细胞激活过程中的多个时间点,我们的研究强调了基因调控可以针对特定的细胞状态。至关重要的是,我们能够将 DNA 变异与特定基因(尤其是细胞类型)在激活过程中不同时间的活性变化联系起来。这种前所未有的粒度是更好地了解 T 细胞激活的关键,为寻求新疗法提供更深入的数据用于免疫疾病。”
标签:
免责声明:本文由用户上传,如有侵权请联系删除!