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全宏基因组分析有助于识别令人沮丧的肠道微生物

导读 在一项为期三年的研究中,来自 Skoltech、俄罗斯科学院瓦维洛夫普通遗传学研究所、以 NA Alexeev 命名的莫斯科第一心理健康诊所和 Ser

在一项为期三年的研究中,来自 Skoltech、俄罗斯科学院瓦维洛夫普通遗传学研究所、以 NA Alexeev 命名的莫斯科第一心理健康诊所和 Serbsky 联邦精神病学和麻醉学医学研究中心的研究人员研究了肠道微生物如何重度抑郁症患者不同于精神健康的人。在分析了肠道微生物组中存在的所有基因后,该团队确定了一种特定的细菌——普拉梭菌——负责健康和抑郁数据集之间最大的功能差异。Biomedicines报道了这些发现,有望用于快速心理健康诊断和“精神生物”药物治疗。

如果你知道与健康人群相比,哪些基因在抑郁症患者中表现得更小或更大,以及哪些细菌对此负责,你可以尝试做两件事。首先,在诊断精神障碍时,可以将粪便微生物群分析作为辅助工具。其次,你可以尝试开发能够使抑郁症患者的肠道微生物群‘正常化’的药物。”

Alexey Kovtun,研究主要作者,生物研究实习生,Skoltech

为了识别“令人沮丧”的肠道细菌,研究人员进行了所谓的全基因组分析。也就是说,他们从一组被诊断患有重度抑郁症的患者和一组精神健康个体的粪便样本中回收并测序了全部细菌 DNA。“结果是我们知道每个组的微生物组中存在哪些基因和细菌种类,以及它们的代表性有多强,”科夫通说。

下一步是确定一组在健康个体和精神障碍患者之间显着差异的基因,并放大这些特定基因,以找出携带它们的细菌中哪些实际上在抑郁症患者的微生物组中过多或不足.

一种特殊的细菌确实脱颖而出。它被称为Faecalibacterium prausnitzii,在重度抑郁症患者的肠道中数量明显减少。我们将它与这些患者的微生物组宏基因组中三个严重不足的基因组联系起来。”

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