由迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心、纪念斯隆凯特琳癌症中心和威尔康奈尔医学院的科学家领导的一项大型研究项目发现，全基因组测序 (WGS) 可以提供更多信息经典霍奇金淋巴瘤 (cHL) 与外显子组测序相比，外显子组测序仅读取蛋白质编码基因。
该团队表明，WGS 可以更容易地检测 DNA 结构变异，例如基因重复，并提供更精确的数据来跟踪与疾病进展相关的突变。该研究发表在《血癌发现》杂志上。
“我们发现，通过使用全基因组测序，我们几乎可以读取基因组蛋白质编码区和非编码区的所有突变，以及结构和拷贝数变异，”首席医师 Craig Moskowitz 医学博士说，西尔维斯特的肿瘤服务热线，米勒学院的医学教授，也是该研究的合著者。“我们发现了许多以前从未记录过的基因组事件。这是我们发现的识别新癌症驱动因素的最佳技术。”
虽然外显子组测序非常富有成效，可以检测到点突变和其他导致癌症的变异，但它描绘了一幅不完整的图景。非编码基因组区域的突变也可以控制基因表达。此外，WGS 识别出范围广泛的结构变异，包括染色体碎裂，其中受损的染色体看起来像是被大锤击中过。
突变特征和肿瘤年表
该研究确定了 cHL 中的许多此类问题，并发现了与化疗相关的突变特征。也许最重要的是，WGS 提供了对癌症如何演变的时间洞察力。重建肿瘤年表可能在治疗选择中发挥重要作用。
“了解肿瘤如何随时间发展非常重要，”西尔维斯特骨髓瘤基因组实验室的联合负责人、医学助理教授、该研究的第一作者 Francesco Maura 说。“我们需要知道获得了哪些突变以及以什么顺序获得。如果我们开具靶向治疗，我们希望它针对整个肿瘤共有的基因组改变，而不是后来出现且相对罕见的亚克隆。”
由于 cHL 细胞(称为霍奇金和里德斯腾伯格细胞)罕见且难以研究，该团队不得不发明一种复杂的分选系统来分离足够多的细胞。这些细胞后来被扩增以有效地对它们进行测序。这种方法与 WGS 相结合，可以为 cHL 和其他癌症提供许多新见解。
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