导读 一组研究人员通过分析手术过程中常规取出的微小眼液滴，绘制了来自眼内不同细胞类型的近 6,000 种蛋白质的图谱。在最近发表在《细胞》杂...
一组研究人员通过分析手术过程中常规取出的微小眼液滴，绘制了来自眼内不同细胞类型的近 6,000 种蛋白质的图谱。在最近发表在《细胞》杂志上的一项研究中，研究人员使用人工智能模型根据这些数据创建了一个“蛋白质组时钟”，可以根据健康人的蛋白质谱预测其年龄。
该时钟显示，糖尿病视网膜病变和葡萄膜炎等疾病会导致特定细胞类型加速衰老。令人惊讶的是，研究人员还在眼液中检测到与帕金森病相关的蛋白质，他们说这可能为帕金森病的早期诊断提供途径。
眼睛是疾病的窗口
“眼睛的神奇之处在于我们可以观察内部并实时看到正在发生的疾病，”资深作者、斯坦福大学外科医生兼眼科教授维尼特·马哈詹 (Vinit Mahajan) 说。“我们的主要重点是将这些解剖学变化与患者眼内分子水平上发生的情况联系起来。”
眼睛是一个很难在活体患者身上取样的器官，因为它和大脑一样，是不可再生的，进行组织活检会造成不可挽回的损害。另一种方法是使用液体活检——从感兴趣的细胞或组织附近采集液体样本。
尽管液体活检可以提供感兴趣区域中存在哪些蛋白质的快照，但迄今为止，它们测量少量液体中大量蛋白质的能力受到限制，而且也无法提供有关哪些蛋白质的信息。细胞产生哪些蛋白质，这对于诊断和治疗疾病很重要。
高级蛋白质图谱和发现
为了绘制眼内不同类型细胞的蛋白质产生图谱，Mahajan 的团队使用高分辨率方法来表征 120 个液体活检中的蛋白质，这些活检取自接受眼科手术的患者的房水或玻璃体液。他们总共鉴定出了 5,953 种蛋白质，是之前类似研究中鉴定的蛋白质数量的十倍。使用他们创建的名为 TEMPO 的软件工具，研究人员能够将每种蛋白质追溯到特定的细胞类型。
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