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基因表达技术迈向半自动化

导读 人类基因组计划产生了人类基因组的第一个序列,揭示了人类生物学的蓝图。二十年后,基因调控网络领域描述了一个复杂的系统,其中数千个基因...

人类基因组计划产生了人类基因组的第一个序列,揭示了人类生物学的蓝图。二十年后,基因调控网络领域描述了一个复杂的系统,其中数千个基因相互调节以创建适当的基因表达动态。

然而,需要做更多的工作来充分理解这些网络并确定它们的精确性质。目前的方法要么间接估计基因调控,要么利用准确、直接但耗时的重复方法。

由京都大学领导的一个研究小组现已开发出一种高度准确的方法来半自动估计多细胞生物中的基因调控网络。该方法涉及测量时间序列基因表达并应用该团队专有的 RANGE 计算模型。该研究发表在《通讯生物学》杂志上。

京都大学生命与医学科学研究所的通讯作者 Masato Ishikawa 表示:“RENGE 可能有助于识别细胞分化的关键因素,并有可能控制特定细胞的命运。”

研究人员可以使用相对准确的基因敲除方法来确定调节基因的表达,如果基因 A 被消除,那么 A 所调节的基因 B 就会暴露出来。

最新的单细胞 CRISPR 技术可以测量大规模个体基因敲除的表达变化,但有一个警告:直接和间接调控基因之间的区别尚不清楚。敲除一个基因不可避免地会影响网络中顺风基因的表达。

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