伦敦大学学院和伦敦弗朗西斯克里克研究所的科学家开发了一种新工具，可以快速估计癌性肿瘤中 T 细胞(免疫细胞)的数量*;由于 T 细胞丰度有助于预测患者对免疫疗法的反应，研究人员希望这可以实现更有针对性和更有效的癌症治疗。
作为英国癌症研究资助的 TRACERx 项目的一部分，科学家们分析了来自患者癌性肿瘤的 DNA 测序数据，看看他们是否可以量化样本中 T 细胞的比例。
解释这项研究的通讯作者 Nicholas McGranahan 博士(伦敦大学学院癌症研究所)说：“经常对癌症患者的肿瘤进行 DNA 测序，以对患者进行分层并了解癌症是如何发展的。
“对于控制癌症、影响患者生存和指导治疗很重要的免疫细胞的估计，过去不可能仅根据 DNA 测序数据进行估计。
“我们旨在探索是否可以开发一种新方法，直接从 DNA 测序中阐明免疫细胞，而无需更多数据。”
DNA 测序使科学家能够看到单个肿瘤如何发展的进化历史。在这项研究中，他们开发了一种工具(或方法)来“回顾”并计算 T 细胞“VDJ 重组”的水平;这是 T 细胞**中的一个过程，在这个过程中它们被重新组装或改变并被赋予工具，使它们能够识别和攻击入侵者。
具体来说，他们发现了一个“信号”，它表明 T 细胞成熟所需的 T 细胞受体切除环 (TREC) 丢失，这在 VDJ 重组期间发生。通过给这种“损失”打分，他们能够准确估计肿瘤中存在的 T 细胞数量。
McGranahan 博士补充说：“我们表明，该评分可用于预测对免疫疗法和免疫逃避机制的反应。
“该分数还可以应用于源自正常血液样本的 DNA 测序数据，这些样本通常收集但直到现在还无法系统地分析免疫内容。”
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