新研究表征肠道病毒组

华盛顿特区 - 2021 年 10 月 19 日- 一项新研究为全球不断增加的人类肠道病毒组添加了许多以前未表征的病毒基因组和基因。该研究发表在美国微生物学会的开放获取期刊mSystems 上，将证明有助于研究肠道病毒组在人类健康和疾病中的作用。

“人类肠道病毒组仍未得到充分探索，许多新病毒有待发现，其中一些可能对影响人类健康和疾病的过程产生重要影响，”该研究的首席研究员、该研究的教授 Jelle Matthijnssens 博士说。微生物学、免疫学和移植系，Rega 研究所，临床和流行病学病毒学部，病毒宏基因组学实验室，KU Leuven，Leuven，比利时。

人类肠道包含一个复杂的微生物生态系统，其中细菌已被广泛研究。Matthijnssens 博士说，对肠道病毒的研究滞后。MicrobLiver 项目的目标是了解宿主与人类肠道微生物组之间的相互作用以及肠道-肝脏轴在酒精性和非酒精性脂肪肝疾病早期的作用。“在 MicrobLiver 项目的框架内，我们的目标是生成病毒基因组目录，该目录可用于后续对酒精性和非酒精性脂肪性肝病早期人群的研究，”Matthijnssens 博士说。

在这项新研究中，研究人员使用来自 204 名丹麦受试者的 254 份粪便样本来生成丹麦肠道病毒目录 (DEVoC)。儿科队列包括 50 名体重指数 (BMI) 高于第 90个百分位数的儿童和青少年(6-18 岁)，以及 50 名年龄和性别匹配的健康对照。成人队列(34-76 岁)包括 52 名酒精相关肝病患者和 52 名性别、BMI 和年龄匹配的健康对照。

研究人员使用新型病毒富集技术 (NetoVIR) 协议从粪便样本中纯化所有病毒颗粒，并使用深度测序技术对其基因组进行测序。(NetoVir 使研究人员能够为下一代测序肠道病毒组学研究获得快速、可重复、高通量的样品制备方案。)

此外，他们使用先进的生物信息学工具识别了近 13,000 个(部分)病毒基因组，其中许多是新的，并且不存在于公共数据库中。

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