路德维希癌症研究中心的一项研究设计了一种高效的方法来产生大量专门设计用于识别新抗原的免疫细胞 - 随机突变的蛋白质的小片段，通常是患者癌症特有的 - 并破坏表达它们的肿瘤。
由调查员 Alexandre Harari 和路德维希癌症研究所洛桑分院主任 George Coukos 领导的路德维希洛桑研究人员团队开发，名为 NeoScreen 的方法显着提高了对患者新抗原的识别，因此具有相当大的前景癌症个性化免疫疗法的发展。一篇描述 NeoScreen 并说明其在临床前研究中的效用和功效的论文出现在最新一期的Nature Biotechnology 中。
“我们想开发一种更好的方法来识别患者肿瘤独特表达的新抗原，并有效地分离和扩增免疫细胞——肿瘤浸润性 T 细胞或 TIL——自发地针对它们，因为正是这些稀有细胞被认为最能摧毁癌细胞，”Harari 说。“NeoScreen 让我们能够做到这一切。更好的是，它允许识别这些 T 细胞用于识别新抗原的特定受体，以便我们可以为患者血液中的其他 T 细胞配备该机器，并将这些细胞用于个性化免疫治疗。”
为了识别新抗原并培养检测它们的 T 细胞，研究人员通常从肿瘤中分离 TIL，并在刺激 T 细胞增殖的免疫因子存在的情况下，将它们与肿瘤的组成细胞一起培养。但由于新抗原特异性 TIL 非常罕见，对 T 细胞生长的大量刺激通常会导致未专门针对新抗原的 T 细胞大量扩增。这可能会淹没此类培养物中最理想的靶向新抗原的 T 细胞。
为了解决这一限制，Harari、Coukos 和他们的同事首先改造了培养分离 TIL 的公司，将抗原呈递细胞 (APC) 添加到混合物中。APC 向 T 细胞展示与疾病相关的抗原，并有助于驱动识别所呈现抗原的细胞的活化和增殖。但是，研究人员没有使用树突状细胞等典型的 APC，而是设计了另一种类型的免疫细胞 B 细胞，使其成为一种高效的抗原呈递细胞。B 细胞被认为是该角色的理想选择，因为它们在血液中的含量要丰富得多，而且比树突状细胞更容易进行基因操作。
然后，研究人员使用计算方法来分析肿瘤细胞的基因组，并确定可以作为新抗原呈现的蛋白质的随机突变部分。接下来，他们用这些蛋白质片段(或将编码这些片段的 DNA 插入 B 细胞中)对经过改造的 B 细胞进行脉冲处理，以使它们呈递抗原。最后，他们将 B 细胞与肿瘤细胞和从该肿瘤中分离的 TIL 一起培养。
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