De Bruin 对蛋白酶体进行化学生物学研究。“它们是一种降解工厂，可以将细胞中的蛋白质切割成更小的碎片。这是一项非常有用的活动：它是细胞清理多余或已损坏蛋白质的一种方式。
蛋白酶体抑制剂抗癌
但有时它可以有效预防蛋白酶体活性，例如治疗自身免疫性疾病和癌症。De Bruin 解释说：“对于特定类型的癌症，细胞中的蛋白质产量比正常情况高得多。如果抑制蛋白酶体，就会阻止降解，蛋白质就会堆积起来，最终杀死癌细胞。例如，市场上已经有用于治疗卡勒氏病(多发性骨髓瘤)的蛋白酶体抑制剂。这些抑制剂的缺点是它们不仅影响癌细胞中的蛋白酶体活性，而且还影响健康细胞中的蛋白酶体活性，这意味着它们有很多副作用。
化学测定法
De Bruin 更具体地研究抑制蛋白酶体活性的方法。他设计了一种同时测量蛋白酶体所有活性的方法。蛋白酶体呈圆柱形;待分解的蛋白质通过圆柱体漏斗，在圆柱体的不同位置被切割。蛋白酶体有六个不同的活性中心，它们充当“剪刀”，选择性地切割蛋白质。De Bruin：“我已经制造出了可以与这些活性中心结合的小分子。我们现在可以同时研究所有六个活跃中心的活动。
特异性抑制剂
然后，他设计了也可以与蛋白酶体活性中心结合的分子，但本例的目的是停止它们的活性。他为每个活性中心制造了一种特定的抑制剂。这些抑制剂现在可用于研究每个活性中心在不同疾病(例如癌症和自身免疫性疾病)中所发挥的作用。实验表明，通过选择性阻断六个活性中心中的两个，可以杀死白血病细胞。
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