来自RIKEN生物系统动力学中心(BDR)的研究人员和合作者首次描述了哈鱼内耳的发育。这项发表在《自然》杂志上的研究为内耳进化提供了一个新的故事，从现代脊椎动物的最后一个共同祖先开始。
在试图理解进化过程时，可能有助于比较相关动物的器官，最终帮助我们更好地理解器官发生——器官发育的过程。这一基本思路有助于指导RikEN BDR的仓谷茂领导的内耳协作研究。
故事从下颌脊椎动物和无颌脊椎动物的区别开始。像人类这样的低洼脊椎动物有内耳和三个半规管，使我们能够感知自己的位置，在世界上保持平衡，特别是能够感受到三维加速度。化石记录显示，古生代的一群无颚鱼只有两个半规管。为了了解导致三条运河的进化变化，研究小组研究了地球上仅存的两种无颚脊椎动物：七鳃鳗和八目鳗。
七鳃鳗被认为有两个半规管，而盲鳗只有一个。然而，黑鱼不再被认为比七鳃鳗更原始。一系列的分子生物学实验可以阐明这个问题。对控制半规管发育的调节基因的分析表明，所有脊椎动物内耳发育的基本模式都是相似的，包括七鳃鳗和八目鳗。关键基因，如Tbx1和Patched，在所有三种脊椎动物中的表达位置相同，时间相同。
下颌脊椎动物的前后管似乎与七鳃鳗管的前后基因同源，而单一的盲鳗管模型可能是一种进化特征，而不是原始状态。下颚和无法无天的鱼的区别在于普通的小腿的存在，它连接着下颚脊椎动物的前后管。目前无法确定普通犊牛是无颌脊椎动物获得的还是无颌脊椎动物丢失的。
进一步的分析集中在Otx1基因上。这个基因是侧管正确发育所必需的，第三根管是下颌脊椎动物独有的。研究人员发现，尽管缺乏侧管，灯盏细辛和哈鱼在发育过程中都在适当的位置表达Otx1。这有点令人惊讶，因为它的表达被认为导致了水平管道进化的出现。相反，似乎耳泡中Otx1的表达是所有脊椎动物的古老特征。
通过研究动物，我们可以更全面地了解动物代表了下颌和无颌脊椎动物分叉前的谱系。
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