费城，2019年8月12日——99%的宫颈癌是由人乳头瘤病毒引起的(人乳头瘤病毒)。200多种人乳头瘤病毒，其中一些与不同程度的癌症风险有关，使诊断和治疗复杂化。爱思唯尔发表在《分子诊断》杂志上的一份报告描述了一种新的“二合一”诊断方法，它不仅能检测人乳头瘤病毒感染的类型，还能指示癌前标志物。该测试可以提高诊断风险最高的人乳头瘤病毒感染的能力，以低成本提供快速结果，并有助于避免不必要的诊断程序。
“我们开发了人乳头瘤病毒RNA-Seq，这是一种新的体外分子诊断程序，用于检测高危人乳头瘤病毒感染，并识别患有高级别鳞状上皮内病变(HSIL)的患者，这是宫颈癌的癌前阶段。“人乳头瘤病毒RNA-Seq是一种独特的检测方法，它结合了分子检测(人乳头瘤病毒分型)和宫颈细胞学(细胞表型分析)的优势，”东巴黎大学巴斯德研究所和法国迈松-阿尔福特国家兽医学院生物研究所病原体发现实验室首席研究员Marc Eloit解释道。
宫颈癌筛查允许在癌症发展之前检测和治疗癌前病变。目前筛查要么侧重于检测人乳头瘤病毒，要么侧重于通过细胞学鉴定异常宫颈细胞。然而，检测病毒的脱氧核糖核酸或核糖核酸的分子诊断测试在识别癌症或癌前病变方面很差。使用巴氏试验分析宫颈细胞，即使结合高危人乳头瘤病毒分子检测，也会导致大量不必要的阴道镜检查，这是一种侵入性检查，医生可以通过它直观地检查宫颈病变。
在这项概念验证研究中，人乳头瘤病毒RNA-Seq用于分析来自55名患者、28名低度鳞状上皮内病变患者(LSIL)和27名HSIL癌前病变患者的样本。
人乳头瘤病毒RNA-Seq可以在一组16个人乳头瘤病毒高危人群中检测并确定人乳头瘤病毒感染的类型，其结果与广泛使用并获得官方批准的人乳头瘤病毒DNA分子诊断试剂盒相当。事实上，人乳头瘤病毒RNA-Seq检测到的两个人乳头瘤病毒阳性患者多于DNA检测到的患者，并且发现了更多患有各种人乳头瘤病毒感染的患者。
发现该测试具有97.3%的灵敏度(检测人乳头瘤病毒的能力)和93.8%的阴性预测值(净现值，无人乳头瘤病毒的可能性)。埃洛伊特教授指出：“有效的宫颈癌筛查需要对高风险的人乳头瘤病毒感染进行高敏感性和NPV，因为人乳头瘤病毒阴性的女性通常只需在几年后再次接受检测。
细胞学被用作对人乳头瘤病毒患者进行分类的快速方法，组织学被认为是宫颈癌诊断的金标准。然而，组织学分析更具侵入性，需要更多时间才能得出结果。为了确定新的检测方法在宫颈癌分类中是否有一席之地，研究人员还将细胞学与人乳头瘤病毒RNA-Seq进行了比较，发现了高级细胞学的标志。人乳头瘤病毒核糖核酸-SEQ的诊断表现令人鼓舞，可以作为分类测试。他们还发现，人乳头瘤病毒RNA-Seq和组织学(PPV，人乳头瘤病毒感染的可能性)的阳性预测值始终高于细胞学和组织学。“与细胞学相比，这一观察有利于人乳头瘤病毒RNA-Seq可能增加的医学价值，”埃洛伊特教授评论道。
埃洛特教授建议，在一些患者中使用人乳头瘤病毒核糖核酸序列有助于消除不必要的阴道镜检查。他还预计，这项技术将允许多个样本同时运行，每次测试的成本将降至10至20美元。这项测试也可以应用于其他与人乳头瘤病毒相关的癌症，如肛门癌和头颈癌。
人乳头瘤病毒RNA-Seq是基于多重逆转录PCR(RT-PCR)和下一代测序(NGS)的双重结合。逆转录聚合酶链反应是一种灵敏的方法来测量少量的核糖核酸，即反映人乳头瘤病毒基因活性的遗传物质。NGS可以准确地表征扩增病毒序列的多样性。通过这种方法，可以在样本中检测到多达16种高风险或假定的高风险人乳头瘤病毒和癌前标志物的存在。
“我们的方法遵循了当前开发用于分子诊断的NGS扩增子板的趋势，同时不断适应传统的分子检测格式。这种灵活性可以使人乳头瘤病毒RNA-Seq成为许多实验室方便、强大和经济的解决方案，”主要作者Philippe补充道。法国巴黎巴斯德研究所感染单位生物学病原体发现实验室博士。
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