美国得克萨斯大学奥斯汀分校海洋科学研究所的科学家发现了近22种新型微生物,其中许多微生物利用甲烷和丁烷等碳氢化合物作为生存和生长的能源——这意味着新发现的细菌可能有助于限制大气中温室气体的浓度,有朝一日可能被用于清理漏油。
在《自然通讯》本周发表的一篇论文中,研究人员记录了加州湾瓜伊马斯盆地极热和深海沉积物中微生物群落的广泛多样性。该团队发现了新的微生物物种,它们不同于以前研究的遗传学,代表了生命之树的新分支。这些物种中的许多都有很强的吃污染物的能力,就像以前在海洋和土壤中发现的其他微生物一样。
论文主要研究者、海洋科学助理教授布雷特贝克(Brett Baker)说:“这表明深海中蕴藏着大量未被开发的生物多样性,微生物可以降解石油和其他有害化学物质。“在海底之下,现在有巨大的碳氢化合物气体储藏——包括甲烷、丙烷、丁烷等。-这些微生物可以防止温室气体释放到大气中。”
这项新的研究代表了瓜伊马斯盆地沉积物中有史以来最大的基因组样本,由前UT博士后研究员尼娜多姆布罗夫斯基(Nina Dombrowski)和北卡罗来纳大学教授安德烈亚斯特斯克(Andreas P. Teske)共同撰写。
研究人员分析了地表以下2000米的沉积物,其中火山活动将温度提高到大约200摄氏度,并恢复了551个基因组,其中22个代表了生命之树中的新条目。根据贝克的说法,这些新物种在基因上的差异足以代表生命之树中的新分支,而有些物种的差异足以代表全新的大门。
自从达尔文在150多年前提出这个概念以来,生命之树一直是人们试图理解的东西,它仍然是这场运动的目标,”贝克说,他之前是一个团队的成员迄今为止最全面的基因组生命树。“试图画一张树图对于理解生物学的各个方面非常重要。通过DNA测序和我们使用的计算机方法,我们越来越接近,事物也在迅速发展。”
世界上只有0.1%左右的微生物可以培养,这意味着有数以千计甚至数百万计的微生物有待发现。
贝克的团队收集了自然沉积物和微生物样本,然后从样本中提取DNA,研究微生物群落与环境中可利用的营养物质之间的相互作用。研究人员对脱氧核糖核酸进行了测序,结合了每个基因组和每个生物体中的基因,并从数据中推断出微生物是如何消耗不同的营养物质的。
“为此,我们试图找到以前研究过的生物,并找到相似之处和不同之处,”目前在荷兰皇家海洋研究所工作的多姆布罗夫斯基说。“这听起来可能很简单,但实际上并非如此,因为我们发现的基因中,有一半以上是迄今为止尚未被描述和未知的基因。”
用阿尔文号潜水器采集样本,阿尔文号潜水器和发现泰坦尼克号一样,因为微生物生活在极端环境中。与贝克和多姆布罗夫斯基合作的特斯克多年来一直在促进瓜伊马斯盆地的样本收集,并与世界各地使用不同方法研究那里生活的科学家合作。
本月,贝克是阿尔文取样小组的成员,该小组此前从未在该盆地进行过研究。
贝克说:“我们认为这可能只是瓜伊马斯盆地多样性的冰山一角。“所以,我们正在做更多的DNA测序,试图了解它的内容。这篇文章实际上只是我们对这些事情以及它们正在做什么的第一个提示。”
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