LSTM的研究人员利用生物信息学方法整合了许多蚊子对杀虫剂抗性研究的信息,发现了许多以前没有被认识到的重要抗性机制。
在《自然通讯》上发表的一项研究中,维多利亚英厄姆博士和她的同事使用专业的计算机编程来更好地理解蚊子对当前公共卫生杀虫剂的抗药性机制。她说:“在抗击疟疾和其他病媒传播疾病的过程中,非常重要的一点是,我们能够充分了解蚊子种群对杀虫剂的抗药性。过去,已经对特定的基因家族进行了广泛的研究。但是,使用数据集成的方法,我们已经证明还有许多其他机制在起作用,我们认为这些机制在消除农药方面非常重要。”
杀虫剂抗药性是对全球公共健康的主要威胁,这降低了病媒控制的有效性。目前,它严重依赖杀虫剂制造蚊帐、室内残留物或空中喷洒。耐药性广泛存在于主要的疾病媒介中,包括那些传播疟疾寄生虫按蚊的媒介。
了解这种抗性的原因对于制定抗性管理策略和为新农药的开发提供信息非常重要。目前,该研究比较了撒哈拉以南非洲地区5年间从抗性和易感嗜人按蚊种群中收集的31个数据集的基因表达模式,以确定模式并提供对杀虫剂抗性机制的见解。
LSTM希拉里兰森教授是这篇论文的资深作者。她说:“在过去的几十年里,由于杀虫剂的使用,大多数疟疾死亡人数已经大大减少。杀虫剂抗药性的增加对这些基本工具构成了可信的威胁。阐述了蚊虫发展了许多防治农药的方法;这些知识是制定应对耐药性战略的关键”
本文中使用的数据收集在一起,可以在LSTM托管的一个新的基于网络的应用程序中获得。该应用程序被称为IR-TEx(杀虫剂抗药性转录本浏览器),可以免费访问,其他研究人员和政策制定者也可以使用它来更好地向他们通报撒哈拉以南非洲不同地方的抗药性机制。该应用程序由英厄姆博士设计,以更易于访问的格式呈现数据,这对于不熟悉编程的人来说更容易。她说:“我们始终认为,这项工作是完全开放的,让别人来解决自己的研究问题。可按蚊种、国家、农药类别综合搜索,可下载。它对用户友好,可以根据现场情况供那些人使用。”
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