许多动物物种由离散的表型组成。自然昆虫种群的一个常见例子是不同颜色图案的出现,这刺激了大量的生态学和遗传学研究。
]。黑色的外观,也就是。显示离散颜色模式的黑色形式可以在许多分类单元中找到,但是它们潜在的基因组基本特征仍然很差。在许多瓢虫(瓢虫)中,成虫鞘翅目上黑色和红色斑块的空间排列在种内有很大差异,形成明显不同的复杂色彩图案。
]。在异色瓢虫中,描述了200多种不同的颜色形式,这是经典遗传学研究表明的单一未知基因座等位基因变异的结果。
]。在这里,我们结合全基因组测序、基于人群的全基因组关联研究、基因表达和功能分析,确定转录因子Pannier控制异色瓢虫的黑色素模式多态性。我们已经证明了pannier对于在鞘翼上形成黑色元素是必要的。游标等位基因的变异导致鞘翅不同区域的蛋白表达,决定了异色瓢虫不同的颜色模式。复合裙之间的等位基因可能是在基因工程领域减少了高度发散序列的170 kb裙,具有50 kb的倒色形式。这可能有助于保持在自然群体中发现的独特等位基因。因此,我们认为,通过顺式调节等位基因的单基因变异,可以在自然群体中产生高度可变的离散颜色形式。
结果和讨论
瓢虫物种长期以来一直被遗传学家和进化生物学家用来研究自然种群中离散颜色模式的起源和维持。尤其是丑角夫人鸟(Harmonia Axyridis)是极乐空间多态色彩模式的象征物种,拥有来自不同地区的200多种色彩模式。
]。然而,四种形式的自然种群出现频率很高
]:有三种不同的黑色形状,有不同的图案(从最暗到最亮,形状为F. ]显著、有斑点、有斑点和有斑点,后来分别称为黑点2、黑点4和黑点nspots)和一种非黑色形式(黄唇鱼,称为红点)。野生异色瓢虫所记录的大量颜色模式归因于等位基因多样性、等位基因形式之间的相互作用以及对环境因素的可塑性反应的结合。
]。杂交证明异色瓢虫的大部分黑色素形态是通过多个等位基因的变异在一个单一的、无特征的常染色体位点上分离出来的。
为了确定这种颜色模式位点的机制和离散颜色模式的变化,我们使用了群体基因组学的方法,该方法利用了自然群体中各种颜色模式的共存。因此,我们首先利用MinION测序仪(TableS1)产生的长读数,完成了异色瓢虫红-nSpots形态学(HaxR)的从头基因组组装。然后,为了详细绘制这个组件的颜色模式轨迹,我们在海信q 2500 (Illumina)上进行了测序,并从代表全球遗传多样性的14个个体中提取了DNA。和异色瓢虫。我们的目标是使用每个池中具有特定颜色的个体的比例作为协变量来描述与池中的表型差异相关的遗传变异。表S2显示了大多数池如何根据颜色形式和地理位置划分个体,以最大化池中特定颜色形式等位基因的比例(n=40至n=100个个体/池)。因为这个性状是单基因的(常染色体),如果所有的颜色模式等位基因都是共显性的(即共显性),那么作图能力就会达到最高。那么每个等位基因的共享频率将直接从汇集个体的颜色模式中导出)。然而,以前的工作表明,观察到的颜色
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