赫尔辛基大学的一个研究小组介绍了一项关于人类转录因子的新的大规模研究,该研究结合了两种最先进的相互作用组学方法,可以快速识别蛋白质-蛋白质相互作用和这一重要基因家族的广泛功能信息。
转录因子 (TFs) 是细胞发育、分化和维持体内平衡最重要的蛋白质组。它们在所有发育阶段的细胞中驱动复杂的基因表达模式。TF 信号传导的缺陷通常会导致发育障碍和疾病。
然而,虽然 TF DNA 结合已被广泛研究,但我们仍然缺乏对 TF 活性和信号传导如何通过与多种蛋白质(例如辅因子、二聚化伙伴、染色质调节蛋白、酶、抑制蛋白)相互作用来控制的系统级理解和一般转录因子。
赫尔辛基大学的一个研究小组决定启动一项大型研究,以阐明 TF 蛋白-蛋白质相互作用和 TF 调控。这项新研究发表在《自然通讯》上。
“我们对 100 多个 TF 进行了全面的相互作用组分析,揭示了 7,000 多个 TF 蛋白质-蛋白质相互作用,其中大部分在核中并在转录调控中发挥重要作用,”HiLIFE 生物技术研究所的研究主任 Markku Varjosalo 说。
研究结果为进一步研究 TF 监管铺平了道路
本研究中发现的大量 TF 相互作用使研究人员能够进行系统级分析,揭示具有特定生物学功能的 TF 组,例如染色质重塑和 RNA 剪接。
“有趣的是,几乎一半的研究 TF 与 TF 的核因子家族相互作用。已知核因子在发育过程中控制过多的基因和器官发生,它们的异常活动与几种人类癌症类型有关。我们的数据表明转录控制NFI 可能受到核因子与其他 TF 相互作用的调节,”该研究的主要作者 Helka Göös 博士说。
该研究首次对人类转录因子的物理和功能相互作用进行了全面而互补的概述。新发现为进一步研究 TF 监管铺平了道路。
“在过去的 10 年里,我们的实验室一直在积极参与识别和研究癌症和免疫缺陷中个体转录因子突变的疾病机制。TFs 已被证明是困难的药物靶标,但它们的几个关键调节剂更有希望。我们生成的关于 TF 的大量信息图谱可以作为药物发现研究的丰富资源,以确定 TF 相关疾病的药物治疗,”Varjosalo 博士说。
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