新泽西州罗格斯癌症研究所(该州领先的癌症中心和唯一的国家癌症研究所指定的综合癌症中心)的研究人员与 RWJBarnabas Health 一起检查了胰腺肿瘤的微生物组,并以单细胞分辨率确定了与炎症和炎症相关的特定微生物。生存不佳。
据研究人员称,这些微生物可能是早期诊断或治疗胰腺癌的新靶点,胰腺癌是美国男性和女性癌症死亡的第四大原因。研究结果发表在Cancer Cell的在线版本上。
微生物是小到肉眼无法看到的生物。我们体内的微生物数量超过了人体细胞的总数,并且可以在胰腺等器官中找到,这些器官曾经被认为是无微生物的。
Subhajyoti De,博士,罗格斯癌症研究所的首席研究员,该研究的高级作者,与研究生 Bassel Ghaddar 一起,他是 MD/Ph.D 的学生。罗格斯大学罗伯特伍德约翰逊医学院的项目开始探索胰腺肿瘤中是否存在微生物,以及它们是否会对癌症进展或治疗产生影响。然而,研究肿瘤中的微生物很困难,部分原因是每个患者都是不同的,而且微生物足迹太微妙而无法可靠地检测到。
为了进一步探索,研究人员与罗格斯大学人类微生物组主席、世界知名微生物组专家、医学博士 Martin Blaser 合作。研究人员开发了一种称为 SAHMI(宿主-微生物组相互作用的单细胞分析)的基因组方法来识别与单个人类细胞相关的微生物。他们使用复杂的软件筛选了数百万个 RNA 序列,确定了哪些可能代表人类基因,哪些是微生物起源的。
“这项新技术使我们能够同时识别肿瘤相关微生物并测量宿主细胞的活性,这是一项重大的技术进步,结果令人震惊,”同时也是副教授的德博士指出罗格斯大学罗伯特伍德约翰逊医学院癌症系统生物学博士。
研究小组对两组独立的胰腺肿瘤进行了研究,发现其中一些具有与肿瘤内特定细胞类型相关的细菌,而这些细胞在正常胰腺组织中基本上不存在。这些细菌主要位于肿瘤细胞内,它们的丰度与癌症相关的细胞活动相关。所发现的微生物的特定特征预示着特别激进的癌症进展和不良预后。
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