威尔康奈尔医学和纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究人员表示，对肿瘤样本中基因活性和代谢物小分子水平进行分类的图谱提供了一种识别癌症深层机制的新方法。
研究人员于 6 月 19 日在《自然代谢》杂志上发表了他们的研究成果，通过结合新的和现有的代谢物和基因活性数据集，创建了癌症代谢图谱 (CAMP)。该图集包含来自 11 种不同癌症类型的 988 个肿瘤和正常组织对照样本的数据。科学家对数据的分析揭示了两大类基因-代谢物的联系，这些联系指出了跨癌症类型的作用机制。
“这个新的图谱将帮助我们建立对肿瘤如何发挥作用的核心理解，”该研究的共同高级作者 Jan Krumsiek 博士说，他是威尔康奈尔医学院生理学和生物物理学助理教授，也是桑德拉和爱德华迈耶癌症中心的成员。
“我们的工作解决了代谢水平和基因表达水平的变化如何协调的基本问题，”另一位研究共同高级作者、纪念斯隆凯特琳癌症中心的计算生物学家 Ed Reznik 博士说。“我们提供的答案是美丽而微妙的：这种协调是由基因编码酶及其代谢底物的分子作用以及肿瘤微环境中代谢独特的免疫细胞的存在串联出现的。”
该研究的共同第一作者是 Elisa Benedetti 博士，她是 Krumsiek 实验室研究期间的研究员。以及研究期间 Reznik 实验室的研究员 Eric Liu 博士和研究生 Cerise Tang 博士。
代谢物是组织和血液中的代谢过程中使用或产生的有机小分子。它们通常参与生化反应，为细胞提供能量，或者作为蛋白质、糖、脂质、DNA 和 RNA 的构建模块。
组织中代谢物水平的模式是生物学中重要的信息层之一，研究人员已经知道癌症中的关键事件，例如肿瘤的发展和耐药性的获得，都伴随着代谢物的显着变化。将这些与癌症相关的代谢物变化与基因活性的变化联系起来有助于科学家理解为什么会发生这些代谢物变化，例如哪些酶或其他蛋白质正在驱动这些变化。在某些情况下，破坏这些机制可能有助于对抗癌症。
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