HIV 抗逆转录病毒治疗被认为是一种治疗方法，而不是治愈方法，因为患者通常携带 HIV 感染细胞库，如果治疗停止，这些细胞可能会重新出现。这些储存库长期以来一直被认为处于休眠状态，但两个独立的研究小组于 9 月 13日在《细胞宿主与微生物》杂志上报告称，这些细胞的一部分会自发产生 HIV RNA 和蛋白质，可能会影响患者的 HIV 特异性免疫反应。
“这是一种具有欺骗性的休眠病毒，”洛桑大学医院、洛桑大学和蒙特利尔大学的免疫病毒学家丹尼尔·考夫曼(Daniel Kaufmann)说，他是其中一篇论文的资深作者。“即使在接受治疗的人中，艾滋病毒仍然具有一些活性，并且它继续与免疫系统相互作用。我们必须了解这些持续的相互作用是否会产生临床相关的后果。”
先前的研究表明，当“休眠”的艾滋病毒储存细胞在实验室中重新激活时，它们会产生病毒RNA和蛋白质，但尚不清楚这种现象是否发生在艾滋病毒感染者体内。考夫曼说：“我们想了解这种现象是否真实，如果是，病毒的哪些部分正在表达，它们是否对免疫系统产生影响。”
为此，研究人员采集了 18 名艾滋病毒感染者的血液样本，这些人都服用抗逆转录病毒药物(这些药物可以阻止艾滋病毒生长，但实际上并没有杀死病毒)超过 3 年。然后，他们使用一种称为 RNA 流式细胞术的实验室方法，根据 CD4+ 或“辅助”T 细胞(HIV 选择性感染的细胞类型)是否感染 HIV，以及它们是否主动产生 HIV RNA 对它们进行分类或蛋白质。研究人员还按角色对 T 细胞进行了表征，例如，它们是对抗细胞内病毒的 T 辅助细胞类型还是对抗细胞外细菌的类型，以确定 CD4+ T 细胞的任何亚型是否更有可能宿主 HIV水库。
我们的技术使我们能够观察单个细胞，看看它们是否含有病毒以及它们表达病毒的哪些部分。对于每位患者，我们可以估计有多少细胞仍然活跃，我们还可以寻找病毒特征和细胞特征之间的关联。”
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