CTCF 是一种转录因子,因其在调节称为MYC的关键癌基因中的作用而成为研究目标。圣裘德儿童研究医院的科学家们发现了直接证据,表明 CTCF 控制着染色质的可及性,即打开紧密缠绕的 DNA 以便表达基因的过程。研究结果发表在基因组生物学上。
CTCF 被生物学家称为基因组的主要调节器,并因严重影响基因组的 3D 结构而闻名。导致其缺失的 CTCF 突变很少见;然而,影响它如何与基因和蛋白质结合的突变在患有癌症等疾病的细胞中很常见。虽然对 CTCF 对基因的下游影响进行了深入研究,但对更直接的影响知之甚少。
“我们对 CTCF 的直接作用的认识存在空白,这对于理解转录过程很重要,”资深和共同通讯作者李春良博士说,圣裘德肿瘤细胞生物学系.“如果你在正确的时间和地点改变基因表达,那么即使是适度的转录变化也会导致疾病发展发生重大变化。”
新技术引领潮流
研究人员使用尖端技术和多学科方法,利用生长素诱导的 degron 系统。生长素诱导的 degron 系统是一种在短时间内以靶向方式降解蛋白质的技术,使研究人员能够更好地了解其主要功能。这些工具对于研究 CTCF 蛋白的急性消耗如何影响细胞是必要的。
“区分 CTCF 的真正生物学具有挑战性,但我们已经使用这些工具提供了直接证据,证明 CTCF 调节染色质的可及性,并为该领域提供清晰度,”共同第一和共同通讯作者徐北思博士说。 .D.,圣裘德应用生物信息学中心。
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