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新西兰鹦鹉的基因健康状况出奇地好

在人类前往新西兰之前,被称为 kākāpō 的极度濒危的不会飞的鹦鹉可能有数十万只。到 1995 年,它们的数量减少到只有 51 只,其中 50 只孤立在小斯图尔特岛上,还有一只名叫理查德·亨利的雄性,它们都独自生活在上。今天,这些数字已经增长到大约 200 人。

现在,对该物种的第一次基因组测序提供了一些令人惊讶的好消息:尽管 10,000 年的岛屿隔离和近亲繁殖,kākāpō 似乎已经失去了潜在的有害突变,而不是积累它们。事实上,与上现已灭绝的种群相比,它们现在携带的有害突变更少。由瑞典和新西兰研究人员进行的分析于 9 月 8 日发表在《细胞基因组学》杂志上。

“尽管 kākāpō 是世界上最近交和濒临灭绝的鸟类之一,但它的有害突变比预期的要少得多,”古遗传学中心和斯德哥尔摩大学的研究员 Nicolas Dussex 说。“我们的数据显示,斯图尔特岛上幸存的种群已经被隔离了大约 10,000 年,在此期间,自然选择在一个称为‘清除’的过程中消除了有害突变,近亲繁殖可能促进了这一过程。”

“在小群体中,这种有害的突变会导致遗传疾病,”古遗传学中心和瑞典自然历史博物馆的LoveDalén(@love_dalen)补充道。“因此,我们发现有害突变数量减少是很重要的,因为这意味着现代种群的近亲繁殖可能没有我们最初想象的那么严重。”

在这项新研究中,研究人员报告了对 kākāpō 的首次全基因组分析,包括高质量的基因组组装。他们一起对 49 个 kākāpō 基因组进行了测序和分析,其中包括 35 个代表唯一幸存岛屿种群的成员和 14 个来自灭绝种群的代表。

科学理论表明,在小种群中,有害突变可能会累积,从而导致灭绝风险增加。但也有可能通过近亲繁殖暴露的有害基因变异可以通过自然选择从种群中消除,这一过程被称为清除。在这项新研究中,研究人员现在发现后一种可能性更准确地描述了 kākāpō 的情况。

研究人员表示,这些发现现在可以用于保护和增加剩余人口的实际用途。例如,基因组数据可用于选择对后代最有帮助的育种个体。“我们表明,来自的单身男性幸存者理查德·亨利比斯图尔特岛的鸟类具有更多的有害突变,”达伦说。“因此,这些有害突变可能会在后代中传播。”

他补充说,另一方面,理查德·亨利 (Richard Henry) 的基因也很独特,可能带有有用的遗传多样性。这意味着必须仔细考虑利弊。因此,仔细监测理查德·亨利 (Richard Henry) 后代的健康状况和基因组以确保它们不会给岛上的人口带来有害的突变非常重要。

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