贝勒医学院的研究人员说,研究基因在基础生物学和疾病中的作用现在更容易、更快、更有效。他们开发了一种基于药物的遗传平台,使科学家能够在实验室果蝇中跟踪遗传操作,而无需筛选数千只果蝇。
研究人员在Cell Reports 中描述了这项新技术的基本原理及其应用示例。STAR Protocols中的一篇配套论文展示了如何设置、执行和分析该技术中涉及的实验程序。免费提供遗传工具和资源,包括质粒库,以帮助研究人员将这种新方法实施到他们的实验系统中。
“实验室果蝇是一种广泛使用的动物模型,用于研究基因和突变对健康和疾病的生物过程的功能,”第一作者尼克·马蒂扬博士说,他是Koen JT 博士的研究生。Venken在贝勒的实验室从事这个项目。他目前是约翰霍普金斯大学医学院的博士后研究员。
为了研究特定基因的功能,研究人员首先将其引入数以千计的果蝇中,然后逐个筛选果蝇以确定哪些果蝇成功整合了该基因。为了区分携带感兴趣基因的果蝇和没有携带感兴趣基因的果蝇,在基因上添加了一种“标签”。传统上,这个标签是在苍蝇中很容易观察到的物理特征。标签可以是特定的眼睛颜色,例如红色,因此研究人员知道红眼睛的果蝇是携带研究基因的果蝇。体色、翅膀或体型是通常用于标记感兴趣的遗传特征的其他身体特征。
Verna 和 Marrs Mclean 的Venken助理教授说:“这个过程多年来一直运作良好,但一个主要的缺点是,在显微镜下逐个目视筛选数千只苍蝇以寻找特定的身体特征会变得非常乏味和耗时。”贝勒生物化学和分子生物学系,该工作的共同通讯作者。
“在目前的工作中,我们开发了一个基于药物的标记系统,用于选择或反选择研究基因,显着改善了筛选过程,”分子和人类遗传学副教授Herman A. Dierick 博士说和贝勒的神经科学以及该工作的共同通讯作者。
简单的选择与费力的筛选
这项新技术背后的想法是,不是用物理特征标记感兴趣的基因,而是用另一个基因标记它们,该基因赋予果蝇对特定药物的抗性或敏感性。研究人员现在可以使用该药物在一组果蝇中选择或反选择携带感兴趣基因的果蝇,而不是手动筛选身体特征。
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