麦克马斯特大学的研究人员开发了一种复杂的新工具，可以帮助提供环境中罕见和未知病毒的早期预警，并识别导致败血症的潜在致命细菌病原体，以及其他用途。
新算法是一种先进的工具，可以帮助开发探针以捕获各种情况下已知和未知的痕量病原体，例如 SARS-CoV-2 等感染的动物与人类传播或监测宿主在可能出现的病原体的环境中。
迄今为止，大多数实验室都有大量测序样本，这是一个费力且成本高昂的过程，通常需要科学家梳理并重新组装特定 DNA 的微小片段，这些片段难以检测并且经常被同一样本或环境中的数十亿其他生物体污染.
例如，临床或野生动物环境中的血液或唾液样本中的病原体特别难以分离，因为它们很容易占样本的不到百万分之一，尤其是在感染的早期阶段，此时浓度仍然很低而检测对患者来说最为关键。
研究人员成功地在包括 SARS-CoV-2 在内的整个家族上测试了这些探针。探针通过靶向、分离和识别相关生物之间共享的 DNA 序列(特别是同时)提供了一条捷径，通常是由于进化历史或祖先。
“有数以千计的细菌病原体，当时间非常重要时，能够确定患者的血液样本中存在哪种病原体可以更快地进行正确的治疗，”该研究的主要作者、该研究的研究生 Zachery Dickson 解释说。生物系。
“该探测器使识别速度更快，这意味着我们有可能拯救可能会死亡的人，”他说。
研究人员还证明了探针捕获与败血症相关的极其广泛的病原体的有效性.
“我们目前需要更快、更便宜和更简洁的方法来检测人类和环境样本中的病原体，从而使狩猎民主化，而这条管道正是这样做的，”该研究的主要作者兼麦克马斯特古 DNA 中心主任、进化遗传学家亨德里克·波纳 (Hendrik Poinar) 说。 .
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