庚糖部分不仅是脂多糖 (LPS) 和荚膜多糖 (CPS) 的组成部分,对革兰氏阴性菌的感染、定植和免疫识别很重要,而且还是多种天然产物的组成部分,具有迷人的魅力。革兰氏阳性菌的生物活性。大多数庚糖单元来自相同的前体,d-sedoheptulose 7-磷酸 (S7-P),戊糖磷酸途径的中间体。原则上,S7-P转化为NDP-庚糖经由通过与异构酶,激酶,磷酸酶,和核苷酸基转移酶活性的酶依次催化的四步过程。ADP-D-甘油-β-D-甘露-heptose 是 ADP 激活的 heptoses 的常见中间体,其生物合成已在革兰氏阴性菌中得到广泛研究。最近,该工作组在阐明革兰氏阳性菌抗真菌抗生素septacidins的生物合成过程中,发现了首个具有异构酶、激酶和核苷酸转移酶活性的三域NDP-庚糖合成酶SepB。SEPB,具有磷酸SEPL一起,合成ADP-D-甘油基-β-D-甘露-heptose通过相同的处理,在革兰氏阴性菌株大肠杆菌。
“SepB 的特殊三域特征引起了我们调查其分布的兴趣。”这项工作的第一作者唐岳博士说。令人惊讶的是,所有 86 个三域同源物(包括 SepB)对于革兰氏阳性细菌的放线菌类都是保守的。“最有可能催化 NDP-庚糖形成的 85 个 SepB 同系物的发现为我们提供了一个很好的机会来了解革兰氏阳性菌中庚糖的生物学意义。”唐说。属于三域 NDP-庚糖合成酶基因的相关基因簇可分为三类,I 型基因簇编码 septacidin 类似物,II 型基因簇指示具有修饰的庚糖部分的天然产物,III 型基因簇负责安装聚糖链。“而且,在 III 型簇中观察到大肠杆菌菌株。考虑到嗜热Aneurinibacillus thermoaerophilus的单域GDP-庚糖合成酶,所有三种形式的NDP-庚糖合成酶都存在于革兰氏阳性菌中,表明庚糖在革兰氏阳性菌中的作用值得关注。”通讯作者陈奕华教授说。四种选定的三域蛋白 Be-6、Cth-2、No-5 和 Sa-4 的酶学表征表明,它们都参与 ADP-d-甘油-β-d-甘露糖-庚糖的生物合成,而后三种蛋白的激酶结构域却出人意料地功能失调。
这些结果表明,作为革兰氏阴性菌,革兰氏阳性菌也是源自 S7-P 的庚糖的丰富来源。该研究更新了革兰氏阳性菌中NDP-庚糖生物合成的现有知识,并为进一步研究含庚糖的天然产物及其生理功能探索奠定了基础。
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