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研究人员挖掘数据并关联驱动神经母细胞瘤的过程

导读 (田纳西州孟菲斯-2020年10月14日)研究人员利用神经母细胞瘤综合基因组分析的见解,了解了导致儿童最常见的实体瘤之一的过程。这些结果揭示

(田纳西州孟菲斯-2020年10月14日)研究人员利用神经母细胞瘤综合基因组分析的见解,了解了导致儿童最常见的实体瘤之一的过程。这些结果揭示了开发精确药物以改善患者预后的可能方法。圣裘德儿童研究医院的科学家领导了这项研究,该研究发表在今天的《自然通讯》杂志上。

对702例神经母细胞瘤标本进行了全基因组、外显子和转录组测序分析。包括来自复发患者的23个样本。这项工作确定了研究人员希望通过治疗使用的常见突状之间的关联。

“这是对大量肿瘤的综合分析,有助于了解神经母细胞瘤中以前未被认识到的相关性,找到罕见的驱动基因突变,”圣裘德氏病科对应作者张景辉博士说。计算生物学。

通信作者是圣裘德发育神经生物学部主任、霍华德休斯医学研究所研究员、迈克尔戴尔博士和费城儿童医院医学博士迈克尔霍加蒂。

常见突变和氧化应激的连接点

研究人员使用一种类似指纹的常见突变模式来识别促进肿瘤生长和扩散的内部过程。研究人员知道,神经母细胞瘤中称为活性氧和氧化应激的脱氧核糖核酸损伤分子会增加。活性氧在细胞的线粒体中产生。分析表明,65%的神经母细胞瘤染色体突变与脱氧核糖核酸损伤分子相关。这些肿瘤有一条额外的17号染色体。这部分包括在线粒体中表达的基因。结果表明,线粒体基因缺陷可能导致活性氧产生增加,从而加重肿瘤的生长和耐药性。

圣裘德云对39种癌症类型的1000多个儿科肿瘤基因组的搜索发现,这种关联并不是唯一的。研究人员报告称,来自另一种癌症(横纹肌肉瘤)的样本中,超过20%的样本线粒体基因表达增加,氧化应激增加。这一发现加强了新发现的线粒体基因缺陷和突变过程之间的联系。

戴尔说:“通过这一分析,我们对驱动神经母细胞瘤的变化有了更深入的了解,包括肿瘤的形成、进展和对治疗的反应。”“这是转化研究的基础。”

神经母细胞瘤预测因子

神经母细胞瘤发生在胎儿神经细胞中,称为神经母细胞瘤,不能正常成熟。虽然7-10%的儿童癌症是神经母细胞瘤,但它占婴儿所有癌症的一半。癌症通常始于肾上腺,但也可能始于胸部、脊柱或脊髓区域、腹部和其他区域。

而且治疗方法和结果因患者年龄而异。最年轻患者(小于18个月)的存活率约为95%。对于老年和高危患者,生存率只有50%左右。

这项研究加强了患者年龄和导致疾病的突变之间的关系。例如,基因MYCN和TERT通常在3.8岁或更小的患者中发生变化,而ATRX突变在中位年龄为5.6岁的儿童中更为常见。

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