圣裘德儿童研究医院的免疫学家创建了一个数据库,可以识别免疫细胞中促进1型糖尿病的基因调节机制。研究结果发表在《自然免疫学》上。
1型糖尿病是一种自身免疫性疾病,其中免疫系统攻击身体自身细胞。在1型糖尿病中,称为CD8 T细胞的免疫细胞杀死胰腺中产生胰岛素的胰岛细胞。通过创建表观遗传图谱,研究人员发现这些T细胞具有双重生物学特征。这种双重特性使T细胞在连续几代T细胞中保持攻击产生胰岛素的细胞的能力。
圣裘德免疫学系的资深作者本扬布拉德博士说:“主要问题之一是为什么这些T细胞能长时间保持功能。”“我们的研究通过确立表观遗传编程在人类T细胞分化中的核心作用,为这种反应的稳定性提供了重要的见解。”
表观遗传学调控
细胞的活动受遗传和表观遗传调控,控制开关给细胞下达指令。表观遗传调控机制包括一个称为甲基化的过程,甲基分子可以在关键点插入DNA分子,抑制其遗传活性。
Youngblood和他的团队绘制了CD8 T细胞基因组的甲基化模式,以了解决定其发育或“分化”的表观遗传过程,这是由称为干记忆T细胞的未成熟细胞进行的。研究人员收集了T细胞各种甲基化模式的数据,从幼稚(还没有攻击性)到活跃的效应细胞。
从图谱中,研究人员发现引起糖尿病的T细胞不仅具有幼稚基因型,还具有与效应子相关的表观遗传程序的双重特征,这首次揭示了该细胞是具有两个程序的表观遗传杂种。
研究人员还对小鼠CD8 T细胞进行了同样的分析,发现它们也表现出这种双重人格。
理解双重人格
理解人鼠图谱的关键是多功效指数,这是由圣裘德应用生物信息学中心的范依平博士和美国医学系临床研究员凯特琳泽布里共同开发的。免疫学。范和泽布雷用最先进的机器学习方法查询这些数据,了解自反应性T细胞的分化状态。利用这一新指标,他们可以证明T细胞基因组中的甲基化位点可以用来预测T细胞分化。
自反应性CD8 T细胞在该指标中得分很高,说明其保留了低分化程度的杂交状态。Atlas和多能指数为1型糖尿病的发展、治疗和诊断提供了重要的新工具。
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