巴西和德国科学家完成了一项合作项目,对巨型淡水鱼Arapaima gigas的全基因组进行测序和分析,这种巨型淡水鱼在巴西被称为pirarucu,在其他地方被称为Arapaima或paiche。它的生长速度是已知淡水鱼中最快的。它的自然分布覆盖了秘鲁和巴西的大部分亚马逊河流域。
这项研究有助于早期性别决定的发现,并促进了雌雄鱼苗的性别特异性繁殖和销售。这也为进一步研究该物种的遗传改良铺平了道路。这项研究的结果得到了FAPESP的支持,并发表在一份科学报告中。
合作始于2015年,当时德国维尔茨堡大学的遗传学家曼弗雷德沙尔特联系了生物学家拉斐尔恩里克诺布雷加和当时的博士生马科斯安东尼奥德奥利维拉。奥利维拉在巴西博托卡的圣保罗州大学水产养殖中心获得博士学位。
Nbrega是该大学生物科学研究所(IB-UNESP)的教授,他提议合作研究巨蜥的性别决定和分化机制。Nbrega说:“它是世界上最大的淡水鱼,也是亚马逊的标志性物种,具有相当大的经济价值,所以Schartl很惊讶它的基因组在当时还不为人所知,基因标记也没有被确定用于性别决定。
Nbrega解释说,青少年没有与性别相关的次级表型差异,因此在早期发育过程中,不能通过形态学来区分男性和女性。关于性别决定和分化机制的信息是巴西水产养殖业的重要发展。
Schartl和他的团队专门研究鱼类的性别决定基因,并了解这种丰富多样的脊椎动物种群的性别分化机制。
青春期前的早期性别决定是研究鱼类生殖周期的关键步骤,此时雄性和雌性在形态和表型上发生分化。
提高知识
基因组草图A. Oyster由帕拉和里奥格兰德联邦大学的研究人员于2018年9月在其他机构之间发表。
Nbrega、Oliveira和合作者最近的测序导致了与巨人症和快速生长特征相关的重要遗传发现。这也说明物种的性别决定和分化与XY染色体的性别决定系统是相容的。
这项研究得到了圣保罗研究基金会FAPESP的支持,并通过了对诺布雷加的常规资助,授予奥利维拉博士学位。
Nbrega说:“虽然巨噬细胞没有可以通过组织细胞分析进行细胞学检测的异型染色体,但我们只鉴定了支持XY染色体性别决定系统存在的男性标记。
2015年,奥利维拉前往巴西北部阿克里州里奥布兰科附近的塞纳多吉奥马德一个名为peixesdamazonia的养鱼场,从60只成年鱼(30只公鱼和30只母鱼)身上采集了数十亿条鱼片。
这些材料被送到沙尔特的实验室,在那里从60个样本中的每一个样本中提取了脱氧核糖核酸。随后,雷恩、图卢兹国家农业研究所和蒙彼利埃大学的研究人员在法国对DNA进行了测序。
“获得了男性和女性不同大小的基因组。男性基因组有6.66亿个碱基对,而女性基因组有6.64亿个。随着鱼类基因组的进入,它们都非常小,只有人类基因组的五分之一大小,有30亿个碱基对,”Oliveira说。
将巨型龙鱼的基因组与另一种多骨舌(亚洲龙鱼)的基因组进行比较,这是唯一一种基因组测序的龙鱼。并与欧洲鳗鲡、大西洋鳕鱼、尼罗罗非鱼、红鳍东方鲀、斑马鱼和原始腔棘鱼等10种不同目鱼类的基因组进行了比较。),它们发展于4亿年前,此后几乎没有变化。
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