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古代基因组揭示的第一个鼠疫历史记录的细�

一个国际研究小组分析了来自21个考古遗址的人类遗骸,以进一步了解鼠疫耶尔森菌在第一次(公元541-750年)中造成的影响和演变。在PNAS发表的一项研究中,研究人员重建了来自英国、德国、法国和西班牙的八个鼠疫基因组,揭示了以前未知的鼠疫菌株的多样性水平。此外,他们还在英伦三岛发现了第一个贾丝汀尼安的直接基因证据。

查士丁尼始于公元541年的东罗马帝国,由查士丁尼一世皇帝统治,并多次爆发,蹂躏欧洲和地中海盆地约200年。同一时期的记录描述了的范围,据估计,当时多达25%的罗马世界人口被消灭。最近的基因研究表明,鼠疫耶尔森菌是这种疾病的原因,但它是如何传播的,以及在期间出现的菌株是如何相互关联的,以前是未知的。

在目前的研究中,由马克斯普朗克人类历史科学研究所领导的一个国际研究小组分析了奥地利、英国、德国、法国和西班牙21个地点的人类遗骸。他们能够重建八个新的鼠疫耶尔森菌基因组,使他们能够将这些菌株与以前发表的古代和现代基因组进行比较。此外,研究小组还发现了英国最早的鼠疫基因证据,这些证据来自阿克希尔的盎格鲁-撒克逊遗址。根据考古年代测定和这种鼠疫耶尔森菌在其进化树中的位置,研究人员得出结论,基因组可能与公元544年不列颠群岛上模糊描述的鼠疫有关。

第一个时期鼠疫菌株的高度多样性

研究人员发现,在6世纪到8世纪之间,欧洲有一种以前未知的鼠疫耶尔森菌多样性。这八个新的基因组来自英国、法国、德国和西班牙。“寻找跨越广泛地理和时间范围的基因组为我们提供了一个机会来评估第一个时期欧洲鼠疫耶尔森菌的微观多样性,”共同第一作者马塞尔凯勒解释说,他是马克斯普朗克研究所的博士生。人类历史科学,现在塔尔图大学工作。新发现的基因组表明,在第一个的200年间,有许多密切相关的鼠疫耶尔森菌流行,其中一些可能在同一时间和同一地区。

虽然可用的基因组数量大大增加,但研究人员无法澄清查士丁尼的发病率。“在第一个出现的几百年前,这个谱系可能出现在中亚,但我们认为目前的数据不足以解决茉莉花起源于人类的问题,这一问题最早是在公元541年在埃及报道的。然而,所有基因组都属于同一谱系的事实表明,欧洲或地中海盆地的在此期间持续存在,而不是被多次重新引入。

两次独立的历史流行病毒株趋同进化的可能证据

这项研究的另一个有趣发现是,出现在第一个末期的鼠疫基因组在其遗传密码中显示出大量缺陷,包括两个毒力因子。大约800-1000年后,在第二个的晚期,鼠疫基因组显示了覆盖基因组相同区域的类似缺失。“这是趋同进化的一个可能的例子,这意味着这些鼠疫菌株独立进化出了相似的特征。这种变化可能反映了对欧亚西部不同生态位的适应,在这两次大流行期间,都在那里传播,”Co首先解释道。作者马克斯普朗克人类历史科学研究所的玛丽亚斯皮鲁。

目前的研究为历史上首次记录的鼠疫提供了新的见解,并提供了历史、考古和古生物流行病学证据的其他线索,有助于回答悬而未决的问题。马克斯普朗克人类历史科学研究所高级作者约翰内斯克劳斯解释说:“这项研究通过比较几千年来的基因组,展示了古生物学研究在理解历史和现代大流行病方面的潜力。“通过对可能存在的鼠疫墓葬进行更广泛的采样,我们希望有助于了解过去和现在大流行期间鼠疫的微观演变及其对人类的影响。”

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