来自INRA、CIRAD、CEA、蒙彼利埃大学、芝加哥和范德比尔特大学的研究人员开发了一种分析沃尔巴克氏体细菌基因组的创新方法。这种内生共生菌感染70%以上的昆虫，可影响登革热或寨卡病毒等病原体的昆虫传播。
通过对淡色库蚊卵巢中的所有DNA进行测序和研究，研究人员首次在这种细菌中鉴定出一种新的可移动遗传元素。这一发现为更好地理解沃尔巴克氏体细菌与宿主蚊子之间的相互作用及其在病原体传播中的作用开辟了新的研究途径。这项发表在《自然通讯》上的研究为生物控制虫媒病原体提供了机会，这是一项重大的公共卫生挑战。
疾病的发病率和与蚊子传播的病原体有关的风险，如疟原虫寄生虫(一种疟疾病原体)和病毒，包括登革热、寨卡病毒、基孔肯雅病、西尼罗河和裂谷热，正在世界各地发展。使用杀虫剂是控制蚊虫种群最常用的方法，但目前使用的不同类型杀虫剂的抗药性非常普遍。在这种背景下，世界正在开发新的工具，根据细菌的使用来控制病原体在自然蚊子群体中的传播，例如沃尔巴克氏体。
在70%以上的昆虫中发现的共生细菌沃尔巴克氏体，可以改变其繁殖，减少病原体在许多蚊子体内的传播，如埃及伊蚊和冈比亚按蚊。目前，它被用于许多主要的生物媒介控制项目，如全球项目“消除登革热”。然而，对沃尔巴克氏体，昆虫和病原体相互作用的分子机制知之甚少。
在个体水平上发展的沃尔巴克氏体基因组分析的创新方法
为了更好地理解内生细菌在病原体传播中的作用并分析潜在的分子机制，来自INRA、CIRAD、CEA和蒙彼利埃、芝加哥和范德比尔特大学的国际科学家团队对蚊子进行了宏基因组分析。为了通过创新的方法重建沃尔巴克氏体细菌的基因组。他们第一次从法国捕获的尖音库蚊卵巢中获得沃尔巴克氏体序列，用单只蚊子代替水池工作，就像传统方法一样。这种新方法确定了沃尔巴克氏体基因组及其可移动遗传元件的新方面。
首次在沃尔巴克氏体中发现质粒
使用短阅读和长阅读测序数据的分析鉴定了沃尔巴克氏体中以前未知的染色体外环状DNA片段，其被称为pWCP(库蚊中的沃尔巴克氏体质粒)。环状DNA有14个基因，细菌中除了染色体似乎还有好几个拷贝。在先前公布的数据中搜索pWCP证实，它存在于从北非收集的更广泛的淡色库蚊样本中。
由于宏基因组学方法的创新，在沃尔巴克氏体中发现这种质粒将能够研究为这种细菌开发新的基因工程工具。这一发现可以为细菌、昆虫及其传播的病原体之间的相互作用机制提供新的一般知识，更具体地说，是细菌调节这些病原体传播的机制。这一知识将直接应用于对导致一些主要动物和人类疾病的病原体昆虫媒介的生物控制。
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