使用常规血液样本,研究人员开发了一种极其灵敏的检测方法,用于检测和量化患者癌细胞中含有罕见基因突变的 DNA 片段。该测定使用“超选择性”PCR 引物,实际上忽略了源自患者正常细胞的大量密切相关的非突变 DNA 片段。这种新的检测方法比目前的方法更快、更便宜,并且可以在广泛使用的仪器上进行。研究人员在《分子诊断杂志》的一份新报告中证明了这种方法的实用性。
“这项研究的长期目标是开发高度多重化验,以便在出现任何症状之前及早发现与癌症相关的突变,并应用有效的早期治疗。这些化验将使用无创液体活检(常规血液样本)在一个人的年度体检期间采集,然后将通过高度多重实时或数字 PCR 技术分析暂时存在于血液样本中的 DNA 片段(源自已死亡的细胞),”首席研究员 Diana Yaneth Vargas 解释说, MS 和 Fred Russell Kramer, Ph.D.,来自美国新泽西州纽瓦克罗格斯大学新泽西医学院公共卫生研究所
当前分析液体活检的技术包括昂贵、冗长且灵敏度有限的下一代序列分析;或者使用 PCR 技术,其中突变 DNA 片段和密切相关的野生型 DNA 片段都被扩增,当突变 DNA 片段很少时限制灵敏度。另一方面,SuperSelective PCR 引物的独特设计能够扩增突变 DNA 片段,同时有效防止大量密切相关的野生型 DNA 片段的扩增。因此,本报告中描述的超选择性 PCR 检测非常敏感。
多重超选择性 PCR 检测,利用频繁的非侵入性液体活检,能够选择和随后修改用于治疗个体癌症的有效靶向疗法。此外,在治疗后,这些化验可能有助于监测患者以检测是否存在微小残留疾病,从而在必要时进行进一步干预。
为了证明他们的方法的临床潜力,对来自癌症患者血浆的六个 DNA 样本进行了分析。来自五名患者的样本是不知情的。进行多重超选择性 PCR 测定以确认每个样品中是否存在特定的人表皮生长因子受体 (EGFR) 突变.选择这些突变是因为它们的存在决定了哪种靶向治疗最有可能对非小细胞肺癌有效。四个样品对不同的 EGFR 靶突变呈阳性,两个样品没有给出 EGFR 靶突变的信号。将盲样本揭盲后,发现两个阴性样本来自没有EGFR突变的患者,而这些样本是特意提供的作为对照。分析确定了其他样本中先前已知的突变。值得注意的是,该分析还在一个盲样本中发现了一种非常罕见的耐药突变,这种突变以前不知道存在,这表明需要改变患者的靶向治疗。
研究人员说:“这些检测方法与传统多重实时PCR的唯一区别是用 SuperSelective 引物代替了传统引物。”“这些检测可以在护理点快速进行,结果可以立即用于为后续的临床决策提供信息。”
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