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2月28日遗传引物使识别粪便污染的潜在来源成为可能

“谁在水里撒尿?”看起来不太可能,这个问题背后有大量的科学依据。确定粪便污染的来源——一个重要的公共卫生问题——需要多年的研究。国家科学研究所 (INRS) 的博士生 Rose Ragot 和 Richard Villemur 教授正在研究遗传引物,这是一种作为测序起点的短 DNA 序列。

引物可以识别粪便污染的潜在来源,特别是在流经城市和农业环境的水中。他们的工作已发表在《环境监测与评估》杂志上。

由于粪便污染是扩散的,因此可能有多个来源,距离受影响区域数公里。因此,必须在粪便中找到正确的遗传指标来控制这种污染。例如,人为污染可能表明废水处理基础设施存在缺陷或化粪池泄漏。牛污染的来源更可能是田间径流或粪便管理不善。

该研究小组找到了识别大多数哺乳动物和鸟类的引物,它们是粪便污染的主要来源。

与因饮食而异的细菌指标不同,这些小的基因序列是物种特异性的,因为它们是基于线粒体 DNA 的。”

Richard Villemur,教授,国立科学研究所

有效的 DNA 测序

这些引物用作环境 DNA 分析的一种读取按钮。测序是使用 PCR 扩增完成的,与 COVID 测试中使用的技术相同。引物告诉设备哪些 DNA 片段需要以大量相同的拷贝进行复制,以确定存在哪些物种。通过一次考虑所有物种,这种创新方法消除了对每个可能的来源进行 PCR 分析的需要。

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