胚胎植入前基因检测
体外受精胚胎的植入前基因检测使研究人员能够在植入前确定是否存在任何潜在的遗传疾病。基因检测目前用于预防罕见的孟德尔疾病。
一些研究还测试了胚胎的心脏病和癌症。这些研究使用了多基因风险评分 (PRS)，其中将多个遗传变异的影响组合成一个预测因子。
用于基因检测的 DNA 材料是从单细胞或少细胞胚胎活检中获得的，这会限制用于测序的 DNA 的数量和质量。因此，胚胎的全面基因组分析是成本和时间密集型的。此外，由于多种技术原因，可能会导致基因组图谱不准确，这也可能妨碍对罕见基因突变的准确检测。
全基因组重建
在目前的研究中，110 个胚胎来自 10 对接受体外受精(IVF) 并进行过临床植入前基因检测的夫妇。十名通过体外受精出生的孩子获得了 DNA，所有这些孩子都获得了植入前基因检测结果。非整倍体植入前基因检测结果显示，68 个胚胎为整倍体，42 个胚胎具有一条或多条非整倍体染色体。
胚胎的全基因组重建是通过对父母双方进行基因组测序和兄弟胚胎的阵列测量来实现的。分子和统计方法的结合被用来将亲本变体与对应于个体染色体的“单倍型”联系起来。
确定每个胚胎的减数分裂重组的位置。此外，组装相关的单倍型片段以近似整个遗传的胚胎基因组。
全基因组重建的准确性评估为
将预测的基因型与出生孩子的基因型进行比较。预计胚胎中平均有 580 万个位点，范围从 5.4 到 640 万个变体。与出生的孩子相比，第三天胚胎活检的预测准确度为 96.3-98.4%，第五天胚胎活检的预测准确率为 98.0-98.9%。
在四对夫妇中，进行了转座酶连接长读长测序 (TELL-Seq) 以进行文库制备。这捕获了稀有变体，增加了每个家族中稀有变体预测的数量和准确性。
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