模式生物对于生物医学研究至关重要，并促成了许多重要的科学发现。对这些模型的基因组进行测序的能力是研究影响人类健康的遗传因素的有力工具。
家鼠(Mus musculus) 和挪威大鼠 (Rattus norvegicus) 由于与人类的遗传相似性而被广泛用于研究。但是另一只啮齿动物正在崛起——;Arvicanthis niloticus，尼罗河鼠。
今天发表在BMC Biology上的新研究为尼罗河大鼠提供了高质量的参考基因组组装，扩大了其作为模式生物的潜力。
我们需要研究工具，使我们能够对尼罗河大鼠做同样的事情，就像我们过去对实验室老鼠所做的那样。拥有参考基因组是朝着这个目标迈进的一步。”
Yury Bukhman，Morgridge 斯图尔特计算生物学小组的计算生物学家，该项目的资深作者
特别是，在实验室小鼠和大鼠存在局限性的两个研究领域中，尼罗河大鼠可作为替代模型。2 型糖尿病和与昼夜节律紊乱相关的疾病。
小鼠和大鼠是夜行动物，因此它们在模拟人类昼夜周期方面的价值较低。此外，他们可以通过高脂肪饮食出现糖尿病前期症状，但很少会出现像患有这种疾病的人类那样的长期糖尿病并发症。
“你可以改变它们的基因，你可以给它们大量的脂肪，或者使用化学物质来加速这个过程。但这是你正在推动动物模型以获得你想要的东西的许多额外的混杂因素，”第一作者说Huishi Toh 是加州大学圣塔芭芭拉分校的助理项目科学家，曾与 Morgridge 再生生物学名誉主任、UCSB 教授 Jamie Thomson 一起工作。
尼罗河鼠是昼夜活动的，在白天像人类一样活跃。然而，与夜间活动的啮齿动物相比，它的眼睛中也有更多的光感受器，这使得它与研究人类视网膜疾病有关——;包括糖尿病视网膜病变。
“在 2 型糖尿病中仍有很多发现的空间，问题难以回答。这就是为什么我们认为也许是时候在新的动物模型上冒险了，”Toh 说。“这是否意味着它更准确，或者您可以替换其他模型?不，当然不是。但是您也可以找到有用的不同信息。”
尼罗河大鼠的另一个好处是它可以作为远交模型，这意味着它的遗传学反映了不同的种群。许多实验室小鼠品系已经进行了几代人的近交，产生了几乎基因相同的稳定种群。这对于减少实验变异性很有用，但在研究导致疾病的复杂遗传因素时用处不大。
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