肺炎是由细菌、病毒或真菌引起的肺泡感染。它是全世界发病和死亡的主要原因之一，造成临床和经济负担以及全球公共卫生问题。人类呼吸道的微生物生态系统(或微生物组)占据不同的生态位。科学家对呼吸道微生物组很感兴趣，因为它通过刺激免疫系统和防止病原体感染来促进人类健康。巴斯德研究所和法国国家科学研究中心的科学家证明，微生物组组成、病原体负荷和临床干预措施会影响嗜肺军团菌引起的细菌性肺炎的严重程度。研究结果发表在《细胞报告医学》杂志上2023 年 8 月 25 日。
在这项研究中，巴斯德研究所 Carmen Buchrieser 领导的细胞内细菌生物学单位的科学家与里昂军团菌国家参考中心主任 Sophie Jarraud 合作，分析了呼吸道微生物群的多样性和组成。细胞内细菌病原体嗜肺军团菌引起的肺炎患者在整个住院期间都应避免感染细菌、古细菌、真菌和原生动物。嗜肺军团菌导致一种被称为退伍军人病的严重肺炎，这种肺炎可以通过吸入淋浴、热水浴缸或空调系统等人工水源中受污染的气溶胶而感染。军团病的死亡率从 5% 到 40% 不等，具体取决于临床情况和地区。危险因素包括年老、已有肺部疾病、吸烟和免疫抑制，大约三分之二的报告病例发生在男性。欧盟军团病确诊病例从2005年的4,693例增加到2021年的10,004例，增长了113%。这种急剧上升的原因之一可能是气候变化，
科学家团队将高通量细菌、古菌和真菌标记基因测序与定量方法相结合，以描述患者在感染过程中以及医院相关干预措施(例如机械通气和呼吸机等)中呼吸道微生物群的发展情况。抗生素的管理)。由 38 名嗜肺军团菌引起的肺炎住院患者组成的独特队列被分析了。该研究的主要作者、巴斯德研究所细胞内细菌生物学部门负责人 Carmen Buchrieser 解释道：“我们发现了复杂的微生物组动态，其中共生微生物和病原微生物共存，它们丰度之间的平衡会驱动微生物组恢复或生态失调。”科学家们观察到，在住院初期，微生物组多样性下降，病原体嗜肺军团菌被抗生素治疗杀死。但这一空缺很快就被其他机会性物种占据，这些物种通常对抗菌药物具有抗药性——这是继发感染预防策略中应考虑的因素。细菌和真菌负荷最高的呼吸道微生物组也表现出较低的多样性和病原体富集度，表明高生物量可能是继发和/或合并感染的生物标志物。最后，科学家们表明军团菌生物量与疾病严重程度和合并症相关，这表明病原体定量应纳入患者监测中。机械通气或施用某些类型的抗生素等临床干预措施会影响微生物组的组成，从而影响疾病的结果。
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