TrackerSci 是一种用于跟踪脑细胞发育和衰老的新工具,为人一生中的细胞变化以及在各种器官研究中的潜在应用提供了新的见解。
医院托儿所通常会在新生儿的小手腕上绑上软带,上面保存着重要的识别信息,如姓名、性别、母亲和出生日期。洛克菲勒大学的研究人员正在对新生儿脑细胞采取相同的方法,但这些新生儿将终生保留其 ID 标签,以便科学家能够追踪它们的生长和成熟情况,作为更好地了解大脑衰老过程的一种手段。
细胞追踪的进展
正如《细胞》杂志上的一篇新论文所述,洛克菲勒遗传学家曹俊跃和他的同事开发的新方法被称为 TrackerSci(发音为“sky”)。这种低成本、高通量的方法已经表明,虽然新生细胞在一生中不断产生,但产生的细胞种类在不同年龄有很大差异。这项开创性的工作由曹实验室的共同第一作者陆子宇和张梅丽莎领导,有望不仅影响大脑的研究,而且还将影响整个人体衰老和疾病的更广泛方面。
“细胞是我们身体的基本功能单位,因此细胞的变化基本上是所有疾病和衰老过程的基础,”单细胞基因组学和群体动力学实验室负责人曹说。“如果我们能够使用这种新技术系统地表征不同的细胞及其动态,我们就可以全面了解许多疾病的机制和衰老之谜。”
稀有而强大
成年哺乳动物大脑中不断产生新细胞,这是与记忆、学习和压力相关的关键过程。它们由祖细胞发育而来,祖细胞是成体干细胞的后代,可分化为特殊的细胞类型。
然而,由于技术限制和细胞稀有性,这个过程是如何展开的在很大程度上尚不清楚。在大脑中寻找祖细胞就像大海捞针一样。在哺乳动物中,它们仅占所有脑细胞的 0.5%。在生命的后期,这个数字会下降到 0.1%,这是由于细胞不稳定(疾病和衰老的核心特征)造成的。
曹研究组织和器官如何维持稳定的细胞群(健康的标志),因此他和他的团队想要研究不同的细胞群如何发育,以及这些不同的神经元细胞是否以相同的方式衰退或形成不同的路径。追踪它们从出生到成熟的细胞寿命不仅可以揭示差异,还可以揭示它们出现的时间。
他的实验室专注于优化单细胞测序方法,这是一种越来越流行的分析方法,专注于单个细胞的基因表达和分子动力学。曹的团队使用组合索引,这是一种复杂但具有成本效益的技术,可以同时分析数百万个细胞。该方法使用与每个细胞独特的分子组装相关的不同条形码来独特地标记细胞分子。通过 TrackerSci,Cao 和他的同事进一步微调了这项技术。这种增强功能能够对哺乳动物器官中稀有祖细胞的动态进行细致的标记和跟踪。
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