转录因子在将基因编码的遗传信息转化为所有细胞和生物体中的蛋白质方面发挥着至关重要的作用。这些调节蛋白结合 DNA,打开或关闭基因,并控制 DNA 转录为蛋白质合成所需的 mRNA 的速率。由于它们在转录控制中的核心作用,许多疾病可以追溯到转录因子失调。抑制它们的活性,特别是在癌症中,提供了治疗潜力,但许多转录因子都有自己的伎俩。它们的激活结构域本质上是无序的,这意味着构成该结构域的氨基酸链缺乏清晰的三维结构。由于缺乏稳定的 3D 结构,几乎不可能设计出与激活域结合的药物。
由博士领导的研究小组。IRB 巴塞罗那、ICREA 和巴塞罗那大学的 Xavier Salvatella 和 Antoni Riera、马克斯普朗克分子遗传学研究所的 Denes Hnisz 和 BC 癌症中心(加拿大不列颠哥伦比亚大学)的 Marianne D. Sadar - 专注于本质无序蛋白质的趋势形成所谓的生物分子缩合物。他们发现,凝结所涉及的机制可用于抑制前列腺癌中的雄激素受体活性。
我们优化雄激素受体抑制剂的基本原理可用于抑制其他转录因子,从而为解决未满足的医疗需求开辟新的可能性。”
细胞液滴,一种靶向转录因子的新方法
生物分子凝聚物类似于显微镜下漂浮在水面上的蛋白质斑点。冷凝物在称为液-液相分离的过程中形成,类似于油滴与水混合时如何聚结。“我们之前观察到,当你向细胞中添加哪怕是极少量的激活分子(例如睾酮)时,雄激素受体就会形成生物分子凝聚物”Shaon Basu 博士说,他现在是夏里特大学的计算生物学家,也是这项研究的第一批研究人员之一。作者与巴塞罗那 IRB 的 Paula Martínez-Cristobal 博士合作。科学家们推测,雄激素受体的激活与其形成液滴的倾向之间可能存在联系。他们与生物物理学家 Salvatella 博士合作,利用核磁共振技术识别了本质上无序的激活域内的几个短片段,这些片段对于相分离至关重要。
此外,相同的短片段对于受体的基因激活功能也是必需的。“我们发现,当蛋白质可溶时,激活结构域中的短序列往往会变得混乱,令人惊讶的是,当蛋白质浓缩在凝聚物中时,这些区域似乎会形成更稳定的螺旋,”Hnisz 博士解释道。短螺旋产生瞬时结合袋,当受体处于凝结物时可以用抑制剂靶向该结合袋。
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