导读 中国科学院合肥物质科学研究院李学凌教授课题组分析热烧伤皮肤基因表达，基于高分辨率细胞类型组模式开发出新的细胞类型特征和流程反卷积。...
中国科学院合肥物质科学研究院李学凌教授课题组分析热烧伤皮肤基因表达，基于高分辨率细胞类型组模式开发出新的细胞类型特征和流程反卷积。
研究结果已发表于烧伤护理杂志研究。
研究烧伤后基因活性的时间线对于确定最佳治疗时间至关重要。 30多年来，科学家主要依靠分析组织中的整体基因活性来了解这些变化。然而，这种方法有局限性——它无法区分不同的细胞类型或这些细胞中的特定基因活性。它仅提供所有细胞类型的基因活性的平均值。
“基因在不同类型的细胞中表现不同。这个想法构成了创建代表每种细胞类型独特分子活性的标签的基础。”李教授说，“但为了进行更详细的分析，我们需要来自组织样本的数据比不同细胞类型的数据还要多。”组织样本一个>
在这项研究中，研究人员开发了一种高分辨率细胞类型反卷积模式方法，通过估计RNA转录本的相对子集来识别细胞类型和表达(CIBERSORTx)来分析汇集的皮肤批量转录组数据，该方法可以识别细胞分数的来源以及导致大量基因扰动的基因表达变化。
这种方法有助于识别和分析皮肤中不同类型的细胞。研究人员使用血液和皮肤样本的数据为八种不同的皮肤细胞类型创建了参考签名，他们将其称为 Sig_Na，在独立数据集上进行测试时，事实证明该参考签名比其他现有的参考签名更准确。
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