纽约(2021年5月26日)-根据国际MetaSUB联盟(International MetaSUB Consortium)的一项研究，从2015年至2017年，从未从全球公共交通系统和医院的采样中收集到大约12,000种细菌和病毒。由Weill Cornell Medicine研究人员领导的跟踪微生物的工作。
这项研究于5月26日发表在《细胞》杂志上，国际研究人员在三年期间内，在32个国家和六大洲的60个城市中收集了近5,000个样本。研究人员使用称为shot弹枪测序的基因组测序技术分析了样品，以检测各种微生物的存在，包括细菌，古细菌(不同于细菌的单细胞生物)以及使用DNA作为其遗传物质的病毒。(使用大流行前研究中使用的DNA分析方法无法检测到其他以RNA为遗传物质的病毒，例如SARS-CoV-2(引起的病毒)。)
该研究领域对于检测已知和未知感染的暴发以及研究不同城市环境中抗生素耐药性微生物的流行具有重要意义。
高级作者克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)博士说：“每次坐在地铁上时，您都可能会与一个全新的物种通勤。” 。Mason博士还是Biotia和Onegevity Health的联合创始人和付费顾问，以及WorldQuant LLC的付费发言人。
当前的研究导致发现了10928病毒和748细菌，这是任何参考数据库中都没有的。
Mason博士与Evan Afshin博士于2015年共同创立了MetaSUB(地铁和城市生物群落的Metagenomics和Metadesign的缩写)，Evan Afshin博士当时是皇后学院的Maclaylay荣誉学院的本科生，现在是生理学和生物物理学的临床研究员在威尔·康奈尔大学(Will Cornell Medicine)就职，并是Onegevity Health的付费顾问。新发布的研究由Drs。Dr.领导。梅森，戴维·丹科(David Danko)是研究期间梅森博士实验室的威尔·康奈尔大学研究生院博士生，当时是威尔·康奈尔医学大学计算生物医学的研究助理Daniela Bezdan。
通过收集微生物样本并分析它们的基因(统称为微生物组)，研究人员希望能更多地了解人类中存在的细菌，病毒和其他微生物。例如，这项研究可能有助于确定抗生素抗性菌株的出现。仅从遗传序列预测抗生素抗性就具有挑战性，但是研究人员能够绘制一些已知与抗性相关的基因，量化其丰度并确认遗传标记赋予抗性的能力。他们发现，某些城市的抗病基因比其他城市更多，并且其中一些基因可能具有城市特有的特征。
标签： 微生物组
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