今天和 100 年前一样,医生通过从患者身上采集组织样本来诊断癌症,他们通常将这些样本固定在福尔马林中进行显微镜检查。在过去的 20 年中,还建立了遗传方法,可以更详细地表征肿瘤中的突变,从而帮助临床医生选择最佳治疗策略。
即使是微小的组织样本也可用于检测蛋白质
现在,来自亥姆霍兹协会 (MDC) 的柏林 Max Delbrück 分子医学中心、柏林卫生研究所 (BIH)、柏林慈善大学和德国癌症协会 (DKTK) 的一组研究人员成功地分析了使用质谱仪详细分析固定肺癌组织样本中的 8,000 多种蛋白质。
“使用我们开发的方法,可以在蛋白质水平对癌细胞中的分子过程进行深入分析 - 并且可以在日常临床实践中大量收集和存储的存档患者样本中进行分析,”MDC 和 BIH 蛋白质组学平台负责人 Philipp Mertins 博士说。“即使是非常小的组织样本,例如通过穿刺活检获得的组织样本,也足以进行我们的实验。”
该研究发表在《自然通讯》杂志上,被认为是德国联邦教育和研究部 (BMBF) 资助的多模态临床质谱靶向治疗抗性 (MSTARS) 研究项目的重大成功。自 2020 年以来,总收入约为 570 万欧元。
由 Mertins 和 Charité 病理学研究所的 Frederick Klauschen 教授领导的研究小组已经能够证明蛋白质——与经常研究但非常敏感的 RNA 分子不同——在样品中保持稳定多年,并且可以精确地量化。“此外,存在于肿瘤组织中的蛋白质尤其能很好地映射疾病进展,”主要作者、默廷斯和克劳申实验室的博士生科琳娜弗里德里希说。“这是因为它们提供了一些信息,例如哪些促进或抑制肿瘤生长的基因在细胞中特别活跃。”
这些方法有望帮助确定每种肿瘤的最佳治疗方法
从该团队对两种肺癌——腺癌和鳞状细胞癌——的分析中获得的图片也变得如此详细,因为研究人员不仅发现了细胞中存在的大量蛋白质,而且还量化了超过 14,000磷酸盐。在磷酸化的帮助下,磷酸化是一种调节磷酸基团与蛋白质可逆连接的机制,细胞通过打开或关闭某些信号通路来控制几乎所有的生物过程。
标签: 肿瘤组织
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