荷兰-法国的研究表明,光学基因组图谱 (OGM) 可以非常快速、有效和准确地检测染色体和 DNA 中的异常。有时甚至比所有现有技术都更好,正如他们在美国人类遗传学杂志上发表的两项概念验证研究中所描述的那样。这种新技术可以从根本上改变细胞遗传学实验室现有的工作流程。
人类遗传物质储存在 46 条染色体(23 对)中。尽管这些染色体相当稳定,但数量或结构的变化仍然可能发生。一个众所周知的例子是唐氏综合症,它是由额外的 21 号染色体(21 三体)引起的。一条额外的染色体会产生很大的不同,而且很容易形象化。但是,染色体中也可能发生各种其他较小的变化。有时 DNA 片段丢失(缺失),有时片段只是重复(复制)或移动到另一个地方(易位)。现有作品也可以翻转(反转),有时插入新作品(插入)。染色体中的所有这些结构异常都可能导致疾病,无论是从出生就存在的先天性遗传疾病,类似于唐氏综合症,或者是获得性疾病,
光学基因组图谱
细胞遗传学是检查染色体是否存在此类异常的遗传学科。为了可视化大小变化,需要几种互补技术,例如 FISH、核型分析和拷贝数变异 (CNV) 微阵列。这些通常是费力的技术,单独只能可视化上述异常的一部分。最近出现了一种新技术——光学基因组映射——它或多或少地结合了以前的技术。但新技术必须在实践中证明自己。在 Radboud 大学医学中心 (Radboudumc),基因组学技术和免疫基因组学副教授 Alexander Hoischen 研究新技术在临床研究中的可用性,并可能在以后的患者护理中使用。
两大优势
Hoischen 立即提到了 OGM 的两个主要优势:“我们现在可以查看极长的 DNA 片段,因此绘制整个染色体所需的片段更少。它更快,产生的错误更少。此外,与其他技术不同,我们没有对 DNA 进行预处理或操作,所以我们着眼于真正的、‘自然’的 DNA。简而言之:所见即所得。”
自动、客观、数字
Bionano 创造了一个标签,可以附着在一个特定的 DNA 片段上,这种片段经常出现,但不规则。标签之间不断变化的距离创造了一个独特的条形码,因此研究人员始终可以准确地知道它们在 DNA 中的位置。这种标记的 DNA 被拉过细长的纳米通道,同时相机连续拍照。Hoischen:“通过这种方式,我们可以快速自动、客观地以数字方式记录 DNA,其分辨率比核型分析高 10,000 倍。这是一种‘类固醇细胞遗传学’,因为它的力量和速度。”
标签: 细胞遗传学
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