与血液相比，甲基化变化还导致 CD4 肿瘤浸润 T 细胞中 341 个差异表达基因的转录组变化。
对参与 CD4 分化和功能的特定基因的分析揭示了肿瘤 CD4 T 细胞中TBX21、GATA3、RORC、FOXP3、IL10和IFNG 的差异甲基化状态。
有趣的是，作者观察到 GBM 组织中 T 细胞功能基因的几种配体的失调，对应于肿瘤浸润 CD4 T 细胞中失调的 T 细胞受体。
这些 Oncotarget 结果表明 GBM 可能通过操纵肿瘤浸润 CD4 T 细胞的分化和功能影响抗肿瘤免疫反应，从而诱导肿瘤浸润 CD4 T 细胞的表观遗传改变。
这些 Oncotarget 结果表明 GBM 可能会诱导肿瘤浸润 CD4 T 细胞的表观遗传改变
来自威斯康星大学麦迪逊分校和印第安纳大学医学院的Mahua Dey 博士说：“幼稚 CD4+ 辅助 T 细胞群以其多功能性和高度可塑性的特性而闻名。”
在肿瘤微环境中，CD4 T 细胞的谱系承诺反映了肿瘤浸润性幼稚 T 细胞内基因表达新程序的启动。
众所周知，GBM 肿瘤微环境具有极强的免疫抑制性，具有多种独特的特性，包括：
受损的细胞免疫不缺乏肿瘤浸润性 T 细胞
常驻和循环小胶质细胞分泌的高水平 TGFβ 和
几种抑制性配体的表达，引起 TME 中细胞毒性淋巴细胞的无反应性和凋亡，免疫检查点表达，以及免疫抑制细胞浸润增加。
全基因组甲基化测序显示，与血液相比，GBM 患者肿瘤的 CD4 T 细胞中有 13571 个独特的差异甲基化区域，主要集中在 TSS 周围。
此外，将来自 RNAseq 分析的转录组数据与 DNA 甲基化相结合，我们观察到 GBM 肿瘤中 CD4 T 细胞(包括 Th1、Th2、Th17 和 iTregs)特异性基因集的差异甲基化，尽管具有显着的患者间变异性。
标签： 胶质母细胞瘤
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