马里兰大学医学院 (UMSOM) 的研究人员推出了一种新的在线工具,可以更快地推进医学发现以逆转进行性听力损失。该工具可以轻松访问数百项涉及听力功能和耳朵的技术研究的遗传和其他分子数据。名为基因表达分析资源 (gEAR) 的研究门户网站于上个月发表在Nature Methods上的一项研究中公布。它由 UMSOM 基因组科学研究所 (IGS) 的一组医生科学家与其他机构的同事合作运营。
该门户允许研究人员快速访问数据并提供易于解释的数据集可视化。科学家还可以输入他们自己的数据并将其与其他数据集进行比较,以帮助确定他们新发现的重要性。
“它为科学家们节省了大量时间,”研究通讯作者、UMSOM 耳鼻喉头颈外科副教授、gEAR 创始人 Ronna Hertzano 医学博士说。“研究人员不仅依赖于识别听力损失基因的突变,还可以轻松识别耳朵中哪些细胞表达任何基因,以及这种表达如何变化,例如,由于噪音暴露或其他物种的再生过程.”
Hertzano 博士和她的团队最近将来自 BRAIN 计划的数据添加到了 gEAR 门户的一个专门领域,以供那些进行神经科学研究的人访问,以更好地了解大脑功能和神经退行性疾病,如阿尔茨海默氏症。该门户是免费的,可供任何寻求访问的研究人员使用。
门户用户可以根据自己的需要进行各种应用。他们可以访问数据集上传器并将他们的数据集添加到 gEAR 中以在私人设置中查看他们的数据。这使他们能够在在线发布结果或提交论文以供发表之前,在其他公共数据的上下文中查看他们的发现。手稿发表后,手稿中可以包含一个永久链接,将读者直接链接到该数据集的精选视图。
“gEAR 门户目前包括 800 多个数据集,我们在输入之前仔细审查了这些数据集,”Hertzano 博士说。“我们目前有超过 1,200 名注册用户和超过 80 次研究引用。现在我们的方法论文发表后,我们预计会大幅增加。”几年前,她和她的同事对门户进行了软启动,并通过与同事的讨论和科学会议上的用户研讨会来宣传其存在。
听力恢复项目是一个由听力健康基金会资助的非营利性研究联盟,它为 gEAR 提供了初步支持,以期更好地了解毛细胞再生的奥秘——为什么耳朵中的毛细胞在某些动物中会再生,而不会在人类中再生.当我们的毛细胞因衰老、过度噪音或接触某些强效药物(如治疗癌症的化疗药物)而死亡时,它们不会自然再生。因此,听力损失通常是永久性的,无法逆转。该联盟使用基因组分析来比较不会再生毛细胞的物种的分子过程。“gEAR 团队与作为我们焦点小组的联盟研究人员密切互动,提供无价的反馈和建议,”Hertzano 博士说。
标签: 听力损失
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