新墨西哥州洛斯阿拉莫斯，2021年4月16日-原子级的大型超级计算机模拟表明，引起的病毒的主要G型变异体更具感染性，部分原因是其具有更强的结合目标的能力与其他变体相比，体内的宿主受体。由洛斯阿拉莫斯国家实验室领导的团队的这些研究结果阐明了G型感染和对其的抗体耐药性的机制，这可能有助于将来的疫苗开发。
“在我们体内，Spike蛋白的基本组成部分之间的相互作用以G形式变得更加对称，这给我们提供了更多与宿主受体结合的机会，” Gnana Gnanakaran说，该论文今天发表在《科学进展》上。“但是同时，这意味着抗体可以更容易地中和它。从本质上讲，该变体抬起头来与受体结合，这使抗体有机会攻击它。”
研究人员知道，该变体(也称为D614G)更具感染力，可以被抗体中和，但他们不知道如何。这项新工作模拟了超过一百万个单独的原子，并需要约2400万个CPU小时的超级计算机时间，提供了有关该变体的Spike行为的分子级细节。
当前的SARS-CoV-2疫苗(可导致的病毒)基于病毒的原始D614形式。对G变体的这种新的理解-在原子水平上对G形式进行的最广泛的超级计算机模拟-可能意味着它为将来的疫苗提供了基础。
该团队在2020年初发现了D614G变体，这是由SARS-CoV-2病毒引起的大流行加剧的结果。这些发现发表在《细胞》杂志上。科学家已经观察到了Spike蛋白的突变。(在所有变体中，都是Spike蛋白使病毒具有特征性的电晕。)这种D614G突变(在SARS-CoV-2基因组中的614位氨基酸被天冬氨酸取代后命名)在全球范围内盛行大约几个星期。
Spike蛋白通过Spike受体结合域与我们许多细胞中发现的特定受体结合，最终导致感染。该结合要求受体结合结构域从不能结合的封闭构象结构转变成可以结合的开放构象。
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