人类肠道微生物组是一个由数万亿微生物组成的复杂社区,这些微生物不断与彼此和我们的身体相互作用。它支持我们的健康、免疫系统和心理健康——但它是如何维持的?
英国和德国的研究人员与其他国际合作者一道,研究了人类肠道微生物组中细菌的进化——询问这些微生物如何在其一生中持续存在——同时考虑了内部和外部影响因素。
该研究的结果将有助于为定制的益生菌、特定食物或补充剂中发现的活细菌以及饮食或医学干预提供信息,以治疗肠道疾病并维持健康的肠道微生物群。
保持稳定、健康的肠道微生物群对我们和细菌都有利。为了换取营养和舒适的栖息地,微生物群落通过为我们提供健康益处来回报我们,我们现在开始了解这一点。
来自 Quadram 研究所和厄勒姆研究所的主要作者和小组负责人 Falk Hildebrand 博士解释说:“我们知道某些微生物在我们出生时就定植在我们身上,有些可以与我们一起生活几十年。然而,尽管研究已经研究了单个微生物物种,但尚未探索整个微生物组中持久性的机制和规模。”
为了检验这一点,位于诺里奇研究园的厄勒姆研究所和 Quadram 研究所的一组科学家以及德国的欧洲分子生物学实验室 (EMBL) 使用宏基因组学来分析人类肠道中不同细菌的进化策略和持久性微生物组。
宏基因组学是对来自人群中许多不同生物的所有基因的研究。就人类肠道微生物组而言,该过程不仅提供了有关现有细菌菌株的详细信息,而且还表明这些不同菌株根据其遗传学增强了保持肠道良好工作状态的能力。
通过分析粪便样本,该团队重新检查了 2,000 多个成人和婴儿样本的宏基因组,其中包括来自同一家族的几个样本,并发现了人类肠道细菌持久性的三种主要传播策略。数据来自之前发表的研究,研究微生物组随时间的变化,每个人平均间隔几个月提供 2-3 个样本。
最后一位作者兼主任 EMBL 海德堡(科学活动)Peer Bork 教授说:“通过研究个人和家庭成员的时间序列,并将其与地理信息叠加,从家庭到城市到国家,我们确定了显示不同的传播策略。这在宿主、区域传播和数百种细菌的地理分布中呈现出非常不同的持久性模式。”
这些数据被构建到一个包含 5,278 个宏基因组的多样化数据集中,用于分析不同类型细菌的持久性模式以及这些模式如何受到共同因素的影响:年龄、家庭成员、地理区域和抗生素使用。
Hildebrand 博士说:“我们的分析表明,微生物组中存在的大多数细菌菌株都非常持久——一种菌株至少持续一年的可能性超过 90%。”
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