纽约州特洛伊——伦斯勒理工学院计算机科学家查克·斯图尔特将加入一个新成立的研究所,该研究所旨在使用生物体的图像来了解生物过程,如物种进化、基因遗传模式,甚至行为。人工智能和计算机视觉生态应用专家斯图尔特将加入新的图像组学研究所,该研究所得到了美国国家科学基金会 (NSF) 1500 万美元的资助。
伦斯勒大学计算机科学系教授兼系主任斯图尔特说:“研究中的一大挑战是发现生命规律。”“图像组学的目标是使用人工智能和机器学习来帮助从图像推断系统发育特征,以了解从物种结构到个体特征和行为的一切。在其核心,我们将使用图像进行生物学预测,生物学家或生态学家可以验证这些预测。”
Stewart是计算机视觉生态应用方面的专家,也是 Wildbook 项目的联合研究员,与Wild Me 合作,为保护研究社区构建开源软件和人工智能。该项目很大程度上借鉴了他和他的学生创建的计算机程序,称为基于图像的生态信息系统,该系统可以识别普通照片中的个体动物,并将它们与存储在数据库中的已知动物的图像进行匹配。
“斯图尔特教授在从多个物种的野生动物图像中提取详细、个性化的信息方面拥有丰富的经验,这使他成为新图像组学研究所的重要成员,”伦斯勒科学学院院长 Curt Breneman 说。“他的创新计算解决方案代表了支撑图像组学新领域的核心使能技术。”
Imageomics 研究所将由俄亥俄州立大学领导,是美国国家科学基金会 (NSF) 作为其利用数据革命计划的一部分创建的科学和工程数据密集型发现的首家研究所。因此,图像组学研究所将成为致力于以计算为基础的发现的国家合作研究网络的一部分。
该研究所将创建一个新的研究领域,其中科学家们使用活生物体的图像作为理解地球上生命的生物过程的基础。这种称为图像组学的新方法将利用机器学习方法从图像中提取生物特征,例如个体的行为或外貌,甚至是物种的独特骨骼结构。图像组学将通过围绕生物知识构建算法基础,并在产生新的生物知识时不断引导和完善它们,从而利用和扩展知识引导的机器学习范式。
与之前将计算应用于人类基因组研究的基因组学类似,图像组学将利用计算机科学帮助科学家从原本难以处理的自然图像数据中提取意义。要研究的图像包括来自博物馆、实验室和其他机构的数字收藏,以及该领域科学家拍摄的照片、相机陷阱、无人机,甚至是将图像上传到 eBird、iNaturalist 等平台的公众,和野书。
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