奥地利第一批21个新型基因组现已完成,并在奥地利科学院分子医学研究中心CeMM最近与维也纳医科大学密切合作发起的“新型突变动力学”项目范围内发布。该项目的目的是对从奥地利患者样本中获得的1000个病毒基因组进行测序,以了解更多关于新冠和致病细菌的分子理解。这个项目的结果将把奥地利病毒的基因组数据整合到新型突变的全球地图中,这将有助于破译新冠背后的突变动力学。
2020年3月12日,由新型引起的新冠被世界卫生组织(WHO)宣布为。据信,该病已从野生动物传播到人类,并于2019年11月在中国湖北省传播。超过180个国家受到影响,新冠病已经造成数千人死亡。
为了了解病毒在人类中的进化,国际研究界已经开始公开提供循环新型病毒的基因组序列。到目前为止,奥地利分离毒株的病毒基因组还没有报道,这是全球传播途径和病毒进化对比分析的一大空白。为了克服这个问题,CeMM首席研究员Andreas Bergthaler和Christoph Bock发起了一个合作项目,旨在通过使用先进的下一代测序技术和复杂的计算分析方法来阐明奥地利患者的新型基因组。
我们与维也纳医科大学病毒学中心合作,开发了一种快速反应策略,以一种省时有效的方式从患者体内产生新型基因组序列。这解决了与国家公共卫生和医学研究相关的问题,例如跟踪新型引起的急性呼吸道疾病不同阶段的感染链或时间分辨病毒分析。"
CeMM项目负责人兼首席研究员
对来自奥地利的29,900个核苷酸的新型基因组的初步序列分析表明,在中国湖北省省会武汉,平均有6个突变与2019年12月分离的参考基因组不同。观察到的突变数量与最近报道的其他新型基因组一致。大多数观察到的突变都会导致病毒蛋白的变化,这为正向选择压力和人类群体进化提供了证据。评估这些突变对病毒生命周期的实际影响以及它们与宿主和免疫系统的相互作用将在未来的研究范围内。正在进行的深入基因组分析聚焦于突变热点,
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