每年夏天，在德国南部、奥地利和瑞士，都会有大量的褐鳟鱼灭绝。慕尼黑技术大学的一个跨学科团队现在发现了神秘的垂死鳟鱼的罪魁祸首。它是由一种以前未知的病毒引起的，这种病毒与感染北大西洋和太平洋鲑鱼的病毒有关。
设置总是位于同一河流段。受害者总是褐鳟鱼。几天之内，它们的皮肤会变黑，动物会死亡。几十年来，研究人员和当局一直在寻找这种神秘的大规模死亡的原因——迄今为止没有成功。
利用尖端的分析方法，RalphKhn教授和慕尼黑工业大学的研究团队现在已经确定了导致褐鳟鱼增生性黑化综合征(PDS)的病原体。
从河边到实验室
“最大的挑战是找到一种无人知晓的病原体。起初，甚至不清楚是细菌、病毒、寄生虫还是环境毒素，”这位生物学家回忆道。
然后他做了十年的科学侦探。研究人员在伊勒河建立了两个实验站——一个位于上游，靠近奥伯斯多夫，从未观察到鱼类疾病；肯普顿附近的二楼，每年夏天都会有褐鳟鱼死去。
在两个地点，研究人员建立了由河水喂养的水族馆。从5月到9月，他们观察了水族馆里的鱼，取出冷冻组织样本，送到TUM实验室进行分析。
寻找下一代技术的线索
观测结果表明，PDS的发展分为三个阶段。起初，鱼看起来很健康。然后是肝、肾等内脏器官的变化。在第三阶段，棕色鳟鱼的皮肤变黑，此后动物很快死亡。“这种疾病的进展很快让我们怀疑PDS是一种病毒性疾病，”库恩说。
为了检测样本中的病毒，研究人员部署了一种被称为下一代技术的现代分子遗传程序。这些程序可以用来严格分析基因组。
首先，鱼类疾病的进展表现在基因反应水平上。随后，研究人员研究了具有相似免疫反应的动物，以确定所有遗传物质的核苷酸序列——鱼及其可能的病原体。
基因大海捞针
研究人员部署了一个计算机程序来确定这组基因数据中的致病病毒。利用深度生物信息学处理，他们成功地识别了病原体的部分遗传谱，并将其与已知病毒的谱进行了比较。
扩展的病毒特异性测序导致病毒基因组的确定。结果：褐鳟鱼死亡的罪魁祸首是鱼呼肠孤病毒。它与感染北大西洋和太平洋鲑鱼的病毒有关，在那里会造成严重的经济损失。
下一步，研究人员希望在实验室中培养这种病毒，并研究为什么它只发生在阿尔卑斯山的一些地区，以及全球鱼类贸易在多大程度上促进了它的传播。
更多信息
TUM基金会Brown Troutdaying(动物学系、水生系统生物学系、动物生理学和免疫学系)的项目由巴伐利亚州环境办公室和巴伐利亚州食品、农业和林业部资助。另一个合作伙伴是巴伐利亚渔业部下属的landshut(巴伐利亚)咨询服务机构。
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