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NEI 研究人员创建了视网膜细胞染色质收缩点的高分辨率图

国家眼科研究所的研究人员绘制了人类视网膜细胞染色质的组织图,这些纤维将 30 亿个核苷酸长的 DNA 分子包装成紧凑的结构,这些结构适合每个细胞核内的染色体。由此产生的综合基因调控网络提供了对罕见和常见眼病的一般基因表达和视网膜功能调控的见解。该研究发表在《自然通讯》上。

“这是视网膜调控基因组拓扑结构与与年龄相关性黄斑(AMD) 和青光眼相关的遗传变异的首次详细整合,这是导致视力丧失和失明的两个主要原因,”该研究的负责人 Anand Swaroop 博士说研究员、高级研究员兼 NEI 神经生物学神经和修复实验室主任,该实验室是美国国立卫生研究院的一部分。

成人视网膜细胞是高度特化的感觉神经元,不会分裂,因此对于探索染色质的三维结构如何有助于遗传信息的表达相对稳定。

染色质纤维包裹着长长的 DNA 链,这些 DNA 链缠绕在组蛋白周围,然后反复循环形成高度紧凑的结构。所有这些循环都会产生多个接触点,其中编码蛋白质的基因序列与基因调控序列相互作用,例如超级增强子、启动子和转录因子。

这种非编码序列长期以来被认为是“垃圾DNA”。但更先进的研究证明了这些序列控制哪些基因被转录以及何时被转录的方式,揭示了非编码调控元件发挥控制作用的具体机制,即使它们在 DNA 链上的位置远离它们所调控的基因。

研究人员使用深度 Hi-C 测序(一种用于研究 3D 基因组组织的工具)创建了一张高分辨率地图,其中包括视网膜细胞染色质内的 7.04 亿个接触点。地图是使用来自四名人类捐赠者的死后视网膜样本构建的。

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